TSKit：树序列的分析、生成与管理

简介：
TSKit是一款用于处理树序列的高效工具包，支持大规模遗传数据的分析、生成及管理，适用于人口遗传学和进化生物学研究。 tskit 简洁的树序列是通过将其祖先编码为沿基因组的一系列相关树来存储一组相关的DNA序列的一种高效方法。这种格式由许多软件库和程序输出，这些工具可以模拟或推断遗传序列的进化历史。tskit 库提供了用于加载、检查和操作树序列的基础功能，并包括计算遗传统计的有效方法。通常，它作为其他软件包的一部分被安装。 对于大多数用户来说，使用 Python API 是最方便的选择，因为它提供了一个高级接口来访问、分析和创建树序列。完整的文档可以在相关资源中找到。此外，tskit 还提供了 C API，这是一个综合的低级工具集用于处理树序列，并且符合C99标准且完全线程安全，可以与C或C++一起使用。关于 C API 的完整文档也可以在相关资料中查阅。