ExceRpt：针对small RNA-seq 数据集的预处理、过滤、比对及报告工具

简介：
ExceRpt是一款专为small RNA-seq数据设计的高效分析工具，提供从数据预处理到结果报告的一站式解决方案。 摘录的小RNAseq流水线 用于对smallRNA-seq数据集进行预处理、过滤、比对和报告的软件。 作者支持： Rob Kitchen，可通过电子邮件联系：r.r.kitchen@gmail.com 内容包括： - exceRpt_smallRNA：此编排设计了单个smallRNA-seq样品的处理、过滤和比对。该脚本是一个makefile。 - mergePipelineRuns.R：此脚本将包含一个或多个包含上述管道输出的子目录或zip文件的目录作为输入。通过这种方式，可以合并来自1个或多个smallRNA-seq样品的结果，生成多个QC图，并将读数计数归一化以备后续聚类和/或差异表达分析。 有关如何使用该软件的说明，请参见exceRpt主页。 安装： - exceRpt_smallRNA：需要许多依赖关系，这些依赖关系要求用户具备一定的UNIX知识。