
GLCM及SHG量化工具-MATLAB代码
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简介:
这段MATLAB代码提供了一套用于分析和量化光栅激光共聚焦显微镜(GLCM)与二次谐波生成(SHG)数据的实用工具,适用于生物医学成像研究。
glcmmatlab代码SHG量化工具
该代码提供用于二次谐波(SHG)图像的量化工具。
运行要求:
- 使用Matlab 2016b或更高版本。
- 已经在R2015a及后续版本中测试过此代码。
入门指南:
要开始使用,请下载并解压相关文件。进入shg-quantification-tools文件夹,然后键入Interface命令以启动用户界面。
功能目标:
- 量化一系列Z堆栈的平均SHG强度。
- 对每个对齐的堆栈生成强度的Z轮廓图,使最大强度的位置在所有堆栈中保持一致。
假设条件:
- Z堆栈已保存为Leica LIF文件格式。
使用方法:
1. 在Lif文件中的一个或多个样本获取一系列z堆栈;
2. 从菜单项选择“ProcessSHGfromLif”;
3. 导入您的Lif文件;
4. 根据需要设置数据选项,例如通过输入特定字符串来过滤只处理包含该字符串的图像。如需仅对名称中带有SHG的所有图片进行分析,则在文本框内键入“SHG”。
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