
化学轨迹分析器:一款开源软件包,用于处理和分析化学轨迹数据
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简介:
化学轨迹分析器是一款开源软件工具,专门设计用于高效处理与解析复杂的化学轨迹数据。这款软件能够帮助科研工作者深入研究分子动态行为及物质变化过程,促进化学、物理等相关领域的科学研究与发展。其模块化架构便于用户自定义功能以适应不同的实验需求,同时支持社区贡献新算法和改进措施,共同推动科学界的数据分析能力提升。
ChemTraYzer利用分子动力学模拟来创建React模型,并且它可以作为开放软件(MIT许可)使用。有关完整说明,请参阅相关文档。
该工具的相关研究论文包括:
1. Döntgen M., Przybylski-Freund M.-D., Kröger L.C., Kopp W.A., Ismail A.E., Leonhard K.,“利用React分子动力学模拟自动发现反应路径、速率常数和过渡态”,《化学理论与计算》,2015年第11期,第2517-2524页。
2. Kröger L.C., Kopp W.A., Döntgen M., Leonhard K.,“评估React性分子动力学模拟中稀有事件的统计不确定性”,《化学理论与计算》,2017年第13期,第3955-3960页。
3. Döntgen M., Schmalz F., Kopp W.A., Kröger L.C., Leonhard K.,“通过混合React分子动力学和量子化学模拟”,相关论文未列出具体页面或卷数信息。
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