
凋亡蛋白亚细胞定位预测的SVM-RFE算法研究.pdf
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简介:
本文探讨了基于支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)算法在预测凋亡蛋白亚细胞定位的应用,并分析其有效性。
获取凋亡蛋白的亚细胞定位信息对于揭示细胞程序性死亡机制以及蛋白质功能解析具有重要意义。由于实验方法确定亚细胞定位耗时且成本高昂,开发快速有效的计算预测方法已成为生物信息学领域的重要研究方向之一。
本研究首先通过位置特异性得分矩阵提取氨基酸组分、二肽组分和自协方差变量等特征来构建蛋白质序列的表示模型;接着利用递归特征消除法进行特征选择;最后采用支持向量机分类器在两个常用数据集上进行了验证。实验结果显示,该方法优于大多数已报道的方法,从而证明了其有效性。
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