
Matlab中的PSF代码-MicroscPSF-Matlab:适用于荧光显微镜的高效精确3D PSF计算
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简介:
MicroscPSF是一款用于荧光显微镜的Matlab工具箱,专门设计用于快速准确地计算三维点扩散函数(PSF),以支持高级成像分析。
PSF的Matlab代码用于荧光显微镜中的三维点扩展函数(3D PSF)计算,该方法基于Gibson-Lanni模型,并在《Journal of the Optical Society of America》A卷第34期第6页发表了一篇文章,具体页面为1029-1034。这一组代码旨在提供荧光显微镜中三维点扩展函数的快速近似计算方法。
该算法比现有的511x511x255尺寸工具快约498倍。PSFGenerator使用的是具有多线程功能的Java语言,而推荐的方法则完全采用纯Matlab编写,并未包含任何编译过程。如果在运行时没有指定显微镜参数,默认设置将会被加载。
具体用法如下:
```matlab
params.size = [256 256 128];
tic;
PSF = MicroscPSF(params);
toc
```
此外,还有一个图形用户界面版本提供更快的计算速度。最后一步插值操作通过mex文件实现,能够将时间成本降低约50%。
```matlab
cd Utilities
mex transformation.cpp
params.size=[256 256 128];
params.fastcom=1;
tic;
PSF = MicroscPSF(params);
toc
```
以上是该代码的主要特性和使用方法说明。
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