
开放药物警戒数据的提取、挖掘与分析工具——OpenVigil(开源)
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简介:
简介:OpenVigil是一款开源软件,用于从公开药物警戒数据库中提取和分析药品不良事件报告数据,帮助研究人员及医疗专业人员进行深入的数据挖掘。
OpenVigil 提供了一个 Web 界面来分析药物警戒性数据,包括治疗(即药物)的自发或系统收集以及观察到的不良事件(“药物副作用”)。该工具支持 FDA 不良事件报告系统 (AERS) 和其他国家的数据源,例如加拿大和德国。基于 Web 的 OpenVigil 分析工具提供了多种分析模式:提取、过滤、数据挖掘及通过不成比例测量进行分析(如比例报告比率或报告优势比),并可导出到电子表格程序(比如 Microsoft Excel)或统计软件(比如 R)。OpenVigil 1 对原始数据进行操作,而 OpenVigil 2 则对清理后的数据使用 drugbank.ca 和 drugs@FDA 的信息。此外,还有专门用于 FDA 官方在线 API 的 OpenVigil FDA 工具。OpenVigil 2 支持通过 ATC 编码或特定化学成分进行查询,并且该项目还包括一个不成比例计算器和一个使用 RxNorm 来映射药物名称的工具。
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