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Gotoh算法的Python实现:利用仿射间隙罚分进行序列比对

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简介:
本文介绍了Gotoh算法在Python中的具体实现方法,并探讨了如何运用该算法和仿射间隙罚分来进行生物序列的有效比对。 Gotoh算法在Python中的实现用于使用仿射间隙罚分对序列进行比对。输入需要是一个.fasta文件,其中包含两个序列(如seq.fasta中所示)以及一个替换矩阵,该矩阵必须具有与matrix.txt文件相同的格式(作为示例提供)。

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