
k近邻算法的Matlab与Python实现-SNFpy:Python中相似性网络融合
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简介:
SNFpy是一款用于Python环境下的机器学习工具包,它基于k近邻算法和相似性网络融合(SNF)技术,旨在增强数据间的关联分析能力。该库为研究人员提供了一种有效的方法来处理复杂的生物信息学问题及其他领域中的聚类任务。
k近邻法的SNFpy软件包提供了Python版本的相似性网络融合(SNF)实现技术,该技术可以将多个数据源整合到一个表示样本关系的图形中。
此软件包需要Python3.5或更高版本。如果已安装正确的Python版本,则可以通过命令终端运行以下命令来安装此软件包:`git clone https://github.com/rmarkello/snfpy.git; cd snfpy; python setup.py install`,或者使用pip直接从PyPi安装最新版的SNFpy。
相似性网络融合是一种技术,最初用于将不同来源的数据合并为一组共享样本。该过程通过构建每个数据源中这些样本的网络来表示每一个样本与其他所有样本之间的相似程度,并随后进行网络整合。这种方法在遗传数据分析中的应用展示了其有效性。
生成和融合相似性网络的过程会采用一种机制降低较弱关系的重要性,然而在整个数据集之间保持一致性的较弱关联则会在融合过程中得以保留。关于SNF的数学原理没有在此简述中详细说明。
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