Gillespie 直接方法随机模拟算法：用于化学反应耦合的 MATLAB 代码

简介：
本工作介绍了Gillespie直接方法在MATLAB中的实现，专门针对化学反应动力学中的随机模拟。该算法精确地捕捉了化学反应网络中分子间的相互作用与转化过程，特别适用于研究复杂生物化学系统和细胞内信号传导路径的动态行为。通过提供一个灵活且高效的计算框架，本代码为深入理解非线性动力学现象提供了强大工具。 这段代码实现了 DT Gillespie 在 1977 年发表于《物理化学杂志》上的随机模拟算法（直接方法）。默认的反应和分析解决方案对应于单细胞基因表达的一个简单模型：Pro-->>M-->P，其中 mRNA (M-->0) 和蛋白质 (P-->0) 衰减。在这个模型中假设基因持续表达，并且细胞体积恒定并设置为统一值。代码绘制了 mRNA 和蛋白质的时间序列以及概率直方图。