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电晕疫情:基于贝叶斯方法的COVID-19预测模型

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简介:
本文提出了一种利用贝叶斯统计方法构建的预测模型,旨在更准确地评估和预测COVID-19的发展趋势及影响。通过分析现有数据,该模型能够为公共卫生决策提供有力支持。 冠状病毒预测模型此仓库包含一个贝叶斯模型,该模型可用于分析和预测本地COVID-19大流行。 方法:这是一个具有随时间变化的接触率(β)的模型。Beta估计值受约束开始于R0的先前分配附近,并随着锁定和限制措施到位而允许其徘徊。先验被置于基于现有文献的动态参数上;未观察到的beta组件使用了一些信息性的先验,从而使模型保持稳定。 要生成澳大利亚数据的图表,请运行相应的Stan模型代码。 欢迎发表评论、反馈、问题和建议:可以通过在这里打开“问题”或“拉取请求”,或者通过邮件与我联系(jamie1212@gmail.com)的方式进行沟通。 当前结果: 这是最新生成的针对澳大利亚的数据预测。请记住,这里适用标准警告和谦虚建模的原则。“理解该图表的一种方法是‘以面值获取报告中的数据,并对病毒的行为方式做出合理的假设以及未来的前景如何?’” 贡献此回购遵循Google的标准开源条件;更多信息可参考相关文档。 请注意,上述信息已经根据要求去除了联系方式等私人信息。

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客服
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  • COVID-19
    优质
    本文提出了一种利用贝叶斯统计方法构建的预测模型,旨在更准确地评估和预测COVID-19的发展趋势及影响。通过分析现有数据,该模型能够为公共卫生决策提供有力支持。 冠状病毒预测模型此仓库包含一个贝叶斯模型,该模型可用于分析和预测本地COVID-19大流行。 方法:这是一个具有随时间变化的接触率(β)的模型。Beta估计值受约束开始于R0的先前分配附近,并随着锁定和限制措施到位而允许其徘徊。先验被置于基于现有文献的动态参数上;未观察到的beta组件使用了一些信息性的先验,从而使模型保持稳定。 要生成澳大利亚数据的图表,请运行相应的Stan模型代码。 欢迎发表评论、反馈、问题和建议:可以通过在这里打开“问题”或“拉取请求”,或者通过邮件与我联系(jamie1212@gmail.com)的方式进行沟通。 当前结果: 这是最新生成的针对澳大利亚的数据预测。请记住,这里适用标准警告和谦虚建模的原则。“理解该图表的一种方法是‘以面值获取报告中的数据,并对病毒的行为方式做出合理的假设以及未来的前景如何?’” 贡献此回购遵循Google的标准开源条件;更多信息可参考相关文档。 请注意,上述信息已经根据要求去除了联系方式等私人信息。
  • 生存卷积COVID-19
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    本研究提出了一种基于生存卷积模型的创新性方法,旨在更准确地预测COVID-19的发展趋势,为疫情防控提供科学依据。 冠状病毒疾病COVID-19在全球范围内造成了严重的健康危机。为了有效预测该疾病的传播趋势、评估遏制措施对感染率的影响,并进行跨国比较研究,现有的传染病建模方法如SEIR模型存在诸多局限性:依赖于许多难以验证的假设(例如基于过去的流感数据拟合),且在较长的时间跨度内预测效果不佳。 为解决这些问题,我们提出了一种新的生存卷积模型。该模型参数较少、能够处理未知患者零日期、潜伏期以及随时间变化的基本再生数等关键因素,从而提供更准确的疾病传播趋势预测能力,并评估各种缓解策略的效果。
  • 新冠代码及数据集 (COVID-19 prediction.zip)
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    本资源包包含用于预测新冠疫情发展趋势的相关代码和历史数据集,适用于数据分析与模型构建。 COVID-19新冠疫情预测代码(含数据集)包含在文件COVID-19 prediction.zip中。
  • SIR变体与LSTMCovid-19混合:SIR_LSTM
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    本研究提出了一种结合改进型SIR模型和LSTM神经网络的混合模型(SIR_LSTM),用于精准预测Covid-19疫情发展趋势。 SIR_LSTM 是一种混合模型,结合了 SIR 变体和 LSTM 模型,用于预测 Covid-19 的发展情况。 不确定性量化工具箱:Chung、Youngseog 和 Neiswanger、Willie 等人(2020)提出了一种超越弹球损失的分位数方法来校准不确定性的量化。 CovsirPhy 开发团队(2020)开发了 CovsirPhy,这是一个使用 SIR 衍生的 ODE 模型进行 COVID-19 分析的 Python 软件包。
  • 分析
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    贝叶斯预测模型是一种统计学方法,利用贝叶斯定理进行数据分析和预测。该模型结合先验知识与观测数据,适用于不确定性推理、机器学习等领域,提供一种动态调整参数的有效手段。 贝叶斯预测模型是基于贝叶斯统计的一种预测方法。与传统统计方法不同,贝叶斯统计不仅依赖于模型和数据的信息,还充分考虑了先验知识的影响。
  • 网络
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    简介:本研究探讨了贝叶斯网络在预测分析中的应用,构建了一个灵活且强大的概率图模型框架,能够有效处理不确定性与复杂关系。 用于预测的贝叶斯网络是一种概率图模型,常被用来进行各种类型的预测分析。这种网络通过图形化的方式表示变量之间的条件依赖关系,并利用贝叶斯定理来进行推理和计算概率分布,从而支持决策制定过程中的不确定性管理与风险评估。在实际应用中,它可以处理复杂的多因素问题并提供基于数据的见解和支持。
  • BGGM:图形
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    简介:本文介绍了一种名为BGGM的方法,它运用贝叶斯理论来优化和解析高斯图形模型,适用于复杂数据集间的条件独立性推断。 BGGM是一个用于在高斯图形模型(GGM)中进行贝叶斯推理的R包。它提供了两种通用方法:估计与假设检验来组织这些方法。前者关注后验或预测分布,后者则涉及使用贝叶斯因子来进行模型比较。 什么是高斯图形模型?简单来说,这是一种捕捉一组变量之间条件依赖关系的方法。具体而言,这种模型通过部分相关性描述了两个变量之间的直接联系,在控制其他所有变量影响的情况下进行分析。 应用领域广泛:在经济学、气候科学、遗传学和心理学等众多学科中都可以看到GGM的应用实例。例如,Millington和Niranjan(2020)探讨了其在经济研究中的作用;Zerenner等人(2014)将其应用于气候变化的研究;Chu等人(2009)则利用它来解析遗传学数据的复杂性;而Rodriguez等人的工作展示了心理学领域内如何运用GGM。
  • 【多变量回归线性回归
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    本项目采用贝叶斯统计框架下的线性回归模型进行多变量数据预测分析,旨在探索各自变量对因变量的影响及其不确定性。 内容概要:基于贝叶斯线性回归模型实现多变量回归预测 原理: 贝叶斯线性回归是一种利用贝叶斯推断方法来估计参数的线性回归技术,在处理多个自变量与因变量关系时尤为有用。具体步骤如下: 1. 设定先验分布和似然函数:假设数据间的关系为线性的,并给出模型参数的高斯分布作为先验。 2. 应用贝叶斯推断计算后验概率,即在给定观测值的情况下更新参数的概率分布。 3. 通过获取后验均值与方差来估计参数。 4. 利用所得的后验分布进行预测。对于新的自变量数据点,我们可以根据模型计算出因变量的可能取值范围及其不确定性。 适用场景及目标: - 在小样本情况下提升准确性:当可用的数据量有限时,传统的统计方法可能会产生偏差或不准确的结果;而贝叶斯框架允许通过引入先验知识来改善估计效果。 - 分析参数的不确定性:该模型能提供关于各参数可靠性的度量方式,这有助于评估预测结果的质量和可信程度。 - 预测目标变量并量化其不确定范围:借助于贝叶斯线性回归技术可以对未来的观测值做出推断,并给出相应的置信区间。
  • COVID-19世界新冠代码及数据集(含代码)
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    本项目提供一套用于预测全球新冠肺炎疫情发展趋势的代码和相关数据集,助力研究者进行模型训练与评估。 COVID-19世界疫情分析源代码及数据集主要包括:获取疫情数据、预处理这些数据,并进行数据分析与可视化工作。使用了matplotlib和PyEcharts库来绘制柱形图、折线图、地图、玫瑰图以及动态条形图,同时利用SIR模型对美国的疫情数据进行了模拟预测。
  • 美国Covid-19covid-us-forecasts)
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    Covid-US-Forecasts提供针对美国COVID-19疫情的专业预测和分析,包括感染率、住院人数及疫苗接种趋势等数据,为公众与政策制定者提供决策参考。 该存储库旨在对美国的Covid-19进行预测并做出贡献。我们使用了一组模型来预测各州内的死亡人数,这些模型包括: - rt估计(EpiNow2):位于models/rt目录下; - 作为案例卷积的死亡数估计(EpiNow2),位于models/deaths-conv-cases目录中; - 时间序列方法的平均集合,在models/timeseries目录内。 为了整合这些模型,我们采用了一种在特定视野和训练窗口范围内进行分位数回归的方法。最终预测结果是通过从scoringutils选择适当的评分规则来确定的。我们的团队每周都会对美国及选定州份未来一周内的累计死亡人数与事故相关死亡人数做出预测更新。 此外,对于更多正在进行的工作,请参见相应部分;其他国家或地区的Rt估算和预报信息也已在存储库中提供。本项目由伦敦卫生与热带医学院传染病数学建模中心的成员共同完成,包括山姆·雅培(@seabbs)及凯思·谢拉等贡献者。