
RSAMatlab代码-FMRI-HCP-Mask提取:此脚本帮助您方便地从HCP-MMP1.0分割中抽取特定的二进制...
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简介:
这是一段用于从人类连接组计划(HCP)MMP1.0分区中便捷提取特定二进制掩码的Matlab代码,适用于功能磁共振成像数据分析。
rsamatlab代码用于从HCP-MMP1.0分解图集中提取特定的体积二进制掩码文件。使用前,请确保已下载并解压缩了包含地图集文件(包括.nii和mmp.csv)的HCP_atlas.zip。
### 如何使用
这是一个简单的脚本,旨在帮助您从人类Connectome项目MMP1.0碎片中获取所需的体积图,并将其保存为二进制掩码。这些图像位于MNI空间内,因此生成的蒙版文件也将处于该坐标系下。
首先查看ROI查找表(mmp.csv),找到感兴趣的区域并记录其代码(在num.roi列)。您可以选择多个或单个感兴趣区域来运行脚本。
接下来调用`create_HCP_mask()`函数。此功能需要以下输入:
- 感兴趣的roi代码
- 包含地图集文件的文件夹路径
输出选项包括保存所有单独的兴趣区(“single”)或者合并为一个大的ROI(sum)。此外,您还可以选择提取左侧、右侧或双侧区域。最后,您可以决定是否扩大生成的掩码。
### 操作步骤
1. 根据需要查找并记录感兴趣的roi代码。
2. 确保所有必要的文件都已正确解压和放置在同一目录下。
3. 调用`create_HCP_mask()`函数,并按照说明输入相应的参数来提取所需的数据。
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