GFF2GTF：一个将 GFF 文件转为 GTF 的 AWK 脚本
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简介：
简介：GFF2GTF 是一款简洁高效的 AWK 脚本工具，专门用于将基因组注释文件从 GFF 格式转换为兼容性更强的 GTF 格式，方便生物信息学研究中的数据处理和分析。
gff2gtf 是一个用于将 GFF 文件转换为 GTF 格式的 AWK 脚本。使用方法如下：awk -f gff2gtf.awk 文件.gff > 文件.gtf，适用于具有 AWK 解释器的操作系统。
该脚本依赖于记录的顺序。虽然规范不要求对 GFF 进行排序，但通常会对记录进行排序处理。
对于 RSEM 的应用，可以使用以下命令：awk -f gff2gtf-strict.awk FILE.gff > FILE.gtf；随后执行 grep -Ev \sgene\s FILE.gtf > rsem-ready.gtf 命令以移除特定标签。
关键词包括：NGS（下一代测序）、遗传学、fasta 格式、DNA 和 RNA 序列分析以及比对和基因组标记。
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