
胶质瘤分级临床和突变特征数据集(R).rar
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简介:
背景描述
胶质瘤是大脑中最常见的一类原发性肿瘤。基于组织学影像学标准,其可分为LGG(低级别胶质瘤)或GBM(多型胶质母细胞瘤)。临床特征与分子突变体谱在分级过程中扮演着重要角色。为了辅助准确诊断神经胶质瘤患者,分子测试方法具有较高的费用。本研究数据集综合考虑了TCGA-LGG和TCGA-GBM脑胶质瘤项目中频率最高的20个基因及其3个临床特征指标。预测目标是确定患者的肿瘤类型,即LGG或GBM。主要研究目的是筛选出一组最优的突变基因集合与临床特征,以提升诊断性能并降低成本。
在该研究数据集中,基于TCGA-LGG和TCGA-GBM脑胶质瘤项目的相关数据,筛选了发生频率最高的20个基因及其3项临床参数进行分析。预测目标是根据患者的分子突变特征及临床表现,将其归类为LGG或GBM类型。通过该研究,我们旨在识别能够准确区分这两种神经胶质瘤的最小基因标志集合,并优化其诊断效率和操作成本。
此数据集由TCGA-LGG与TCGA-GBM脑胶质瘤项目整合而成,记录了具有相关特征信息的患者样本。每个记录包含20个分子变化指标(基于Case_ID)及其3项临床参数。值得注意的是,在预处理阶段,我们排除了所有包含不完整信息的样本。
此外,在数据清洗过程中,我们忽略了与研究无关的信息,包括Project、Case_ID和Primary_Diagnosis列的相关内容。年龄特征值通过将日期转化为连续值的方式进行了标准化处理。
此数据集还涵盖了完整的临床参数集合,其中包括详细的分子变化指标(如突变状态)以及人口统计学信息。
在变量描述方面:
- Grade:神经胶质瘤分级指标(LGG=0、GBM=1)
- Gender:性别分组(男性为0,女性为1)
- Age_at_diagnosis:诊断时的年龄值
- Race:种族分类(白人0,非裔或非洲裔美国者1,亚洲2,原住民3)
- IDH1突变状态
- TP53突变状态
- ATRX突变状态
- PTEN突变状态
- EGFR突变状态
通过该研究数据集的分析,我们能够更深入地了解神经胶质瘤的分子特征及其与临床表现之间的关系。
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