easySFS: 有效选择人口规模投影用于构建站点频谱，并将VCF转换为dadifastsimcoal样式的SFS进行人口统计分析

简介：
easySFS是一款工具软件，它能够有效地从VCF文件中生成适用于dadifastsimcoal的SFS（位点频率光谱），从而支持复杂的人口遗传学模型构建与模拟。 easySFS是一个用于有效选择人口规模投影以构建站点频谱的工具。它可以将VCF文件转换为适用于dadi、fastsimcoal或momi2样式的SFS格式，以便进行人群统计分析。 为什么需要这种工具？ 在缺少值的数据矩阵上无法连贯地构造出位点频率分布（SFS）。数据丢失是类似于RADSeq这类数据分析中的显著特征。仅删除缺失的站点会导致大部分有价值的信息被丢弃。另一种方法是对缺失值进行估算，但这只适用于少量缺失的情况；如果大量数据存在缺失，则这种估计会变得不可靠。向下投影是一种折中方案：通过将样本大小缩小并平均所有可能的重采样来构建完整的数据矩阵。 关于如何选择合适的投影值，Gutenkunst等人在2009年提供了一些指导。