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VMTK:血管建模工具包

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简介:
VMTK(血管医学成像工具包)是一款开源软件,专门用于处理和分析血管图像数据。它提供了丰富的算法来支持血管分割、重建及可视化,是科研与临床研究中的重要资源。 血管建模工具包(VMTK)是一系列用于基于图像的血管建模的库与工具集合,涵盖3D重建、几何分析、网格生成及表面数据分析等领域。用户可以通过独立接口或作为医学图像处理平台的一部分来使用它,这些接口包括Python和C++库,并且适用于各种技术水平的人群——无论是临床医生、研究人员还是教育机构。 VMTK提供了详细的入门教程以及开发说明等信息以帮助新用户上手。此外,文档中还详细介绍了如何安装VMTK并指导使用者在该平台内打开数据集及进行3D体积导航和图像处理设置。同时还有关于Pypes的使用指南,通过一系列教程向用户提供主要功能的操作方法。 除了基础介绍外,VMTK还提供了自动生成的Python类引用与C++类参考,并辅以实例截图帮助理解。此外还包括了简报形式的技术演示文档来展示其特点和应用案例。 在具体特性方面,基于梯度的3D水平集分割是其中一个关键功能点之一,通过该技术可以从CT或MR图像中重建血管段的三维表面模型。

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客服
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  • VMTK
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    VMTK(血管医学成像工具包)是一款开源软件,专门用于处理和分析血管图像数据。它提供了丰富的算法来支持血管分割、重建及可视化,是科研与临床研究中的重要资源。 血管建模工具包(VMTK)是一系列用于基于图像的血管建模的库与工具集合,涵盖3D重建、几何分析、网格生成及表面数据分析等领域。用户可以通过独立接口或作为医学图像处理平台的一部分来使用它,这些接口包括Python和C++库,并且适用于各种技术水平的人群——无论是临床医生、研究人员还是教育机构。 VMTK提供了详细的入门教程以及开发说明等信息以帮助新用户上手。此外,文档中还详细介绍了如何安装VMTK并指导使用者在该平台内打开数据集及进行3D体积导航和图像处理设置。同时还有关于Pypes的使用指南,通过一系列教程向用户提供主要功能的操作方法。 除了基础介绍外,VMTK还提供了自动生成的Python类引用与C++类参考,并辅以实例截图帮助理解。此外还包括了简报形式的技术演示文档来展示其特点和应用案例。 在具体特性方面,基于梯度的3D水平集分割是其中一个关键功能点之一,通过该技术可以从CT或MR图像中重建血管段的三维表面模型。
  • Elixir:用于一维拟的Python
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    Elixir是一款专为一维血流建模设计的Python工具包。它提供了便捷的接口来构建、求解和分析复杂的人体循环系统模型,适用于科研与教育领域。 长生不老药的论述似乎与主题有些偏离了,我将忽略这一点并重新组织剩余的内容。 对血液流动的研究尤其是系统性动脉脉搏波传播建模是医学界关注的重点领域。我们开发了一个程序包来模拟大型动脉中的血流和压力情况,通过求解基于弹性管内不可压缩牛顿流体的Navier-Stokes方程的一维非线性模型实现这一目标。值得注意的是,我们的方法不依赖于离散技术(如Lax-Wendroff法),而是采用自动微分来达到类似的效果。 模拟系统动脉中的血流和压力已成为理论与临床研究者共同关注的话题,并且这项工作具有重要的跨学科意义。该项目旨在创建一个软件包,利用我们开发的模型进行相关模拟,以期能更好地治疗心血管疾病。这一目标至关重要,因为发达国家中大多数死亡案例都归因于心血管疾病,这些疾病的产生主要与动脉异常流动有关。 最初项目的灵感来自于先前及目前基于数学模型构建麻醉模拟器的努力。其中一个重要方面是为心脏血管系统建立有效的模型。
  • 数学.zip
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    本资源为《数学建模工具包》,包含常用数学建模软件及工具,适用于学术研究和竞赛准备,助力高效解决复杂问题。 常用的建模数据程序可以根据需求下载,包含了所有建模所需的软件,并可以直接运行使用。只需根据实际需要对数据稍作调整即可。
  • MATLAB数学
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    MATLAB数学建模工具包是专为解决复杂科学与工程问题设计的一套高效工具集,支持数据拟合、优化及仿真等多功能应用。 本工具箱主要包括三个部分:支持平台为MATLAB5.3或5.2版本(包含Symbolic math, optim, spline, stats模块)。具体内容如下: 1. 提供了常用数学建模工具的中文帮助文档; 2. 包含了一些贡献给社区的MATLAB数学建模工具,这些工具通常用星号标记; 3. 收录了中国大学生数学建模竞赛历年试题的相关MATLAB程序。 安装步骤: 1. 将MATHMODL.zip文件解压缩到matlab11\toolbox目录下。 2. 启动Matlab,在Path Browser中使用Add path菜单将路径添加至当前工作环境,确保新加入的path位于最前,并保存设置; 3. 回到你的主目录。此时,MATHMODL已经成为一个常规工具箱了。 可以通过输入命令help mathmodl来查看更多内容或直接运行mathmodl学习教程。 数据拟合: - 一元函数插值:interp1 - 样条插值:spline - 多项式拟合/插值:polyfit - 曲线拟合:curvefit - 各种边界条件的样条插值:caspe - 样条拟合:casps - 二元函数插值:interp2 - 不规则数据的二元函数插值:griddata 方程求根: - 矩阵逆运算:inv - 多项式求根:roots - 一维非线性方程零点搜索:fzero - 非线性方程组解法:fsolve - 符号方程解析解:solve - 牛顿迭代法解非线性方程:newton 微积分和微分方程: - 差分计算:diff - 导数运算(符号): diff - 梯形法则数值积分:trapz - 高精度数值积分方法:quad8 - 符号函数的不定/定积分数值解法:int, quadg - 二重矩形区域积分算法:dblquad - 常微分方程求解器(推荐): ode45 - 微分代数方程解析解方法:dsolve 随机模拟和统计分析: - 最大值/最小值计算:max, min - 向量元素的总和或均值:sum, mean - 均方差估计函数:std - 升序排序(向量、矩阵): sort - 按某一列进行升序排列 (多行数据) :sortrows - 生成均匀分布/标准正态分布随机数:rand, randn - 整数重新排列和置换方法:randperm, randmix - 线性回归分析模块:regress - 统计分类工具箱函数: classify 数学规划: - 线性规划求解器(5.3版):lp, linprog - 一维非线性优化问题的极值搜索方法:fmin - 多元非线性最优化算法(拟牛顿法) : fminu - 单纯形搜索策略用于多元函数极值求解: fmins - 非线性规划工具:constr, fmincon 离散优化: - 枚举法解决组合型问题:enum - 蒙特卡洛方法应用于随机抽样或模拟实验设计 : monte - 线性和整数规划问题求解器(5.3版) :lpint , L01p_e, L01p_ie - 非线性混合整数优化:bnb18 - 用于非线性整数规划的图形界面工具(仅限于MATLAB5.3): bnbgui - Kruskal算法和Dijkstra算法实现最小生成树与最短路径计算 : mintreek, minroute - 非矩形域二重积分:dblquad2 图形绘制: - 二维曲线绘图指令:plot - 三维空间中的参数化方程可视化工具: plot3 - 空间曲面的网格表示方法:mesh - 自定义非规整网格下的表面渲染 : meshf - 利用鼠标交互式地生成光滑线条或区域图形绘制辅助功能:draw 中国大学生数学建模竞赛题解: 包含历年赛题及配套程序,如捕鱼策略、节水洗衣机优化设计等。
  • MATLAB数学
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    MATLAB数学建模工具包是专为解决复杂科学与工程问题设计的强大软件包,集成了数据拟合、仿真及应用开发功能,适用于各类数值计算任务。 本工具箱主要包括以下三部分内容(支持平台为MATLAB5.3或5.2, 包含Symbolic math、optim、spline、stats): 1. 提供了常用的数学建模工具的中文帮助; 2. 收录了一些用户贡献的MATLAB数学建模工具(带*号标记); 3. 中国大学生数学建模竞赛历年的试题及相应的MATLAB程序。 安装步骤如下: 1. 将MATHMODL.zip文件解压缩至matlab11toolbox目录下。 2. 启动Matlab,使用Path Browser中的Add path菜单将路径增加到matlab11toolboxmathmodl,并将其置于最前面并保存设置; 3. 回到你的工作目录。此时,MATHMODL已成为一个普通的工具箱。 可以通过输入命令help mathmodl来查看内容或直接用命令mathmodl学习教程。 数据拟合部分包括: - interp1:一维函数插值 - spline:样条插值 - polyfit:多项式拟合 - curvefit:曲线拟合
  • VesselSeg-Pytorch:用于视网膜分割的Pytorch
    优质
    简介:VesselSeg-Pytorch是一款基于Pytorch开发的视网膜血管分割工具包,旨在提供高效、准确的视网膜血管自动识别解决方案。 VesselSeg-Pytorch:基于pytorch的视网膜血管分割工具包 介绍: 该项目是使用Python和PyTorch框架开发的视网膜血管分割代码库,包含数据预处理、模型训练与测试及可视化等功能模块。适用于从事视网膜血管分割研究的研究人员。 要求: 项目的python环境所需的主要软件包及其版本如下所示: - python:3.7.9 - pytorch:1.7.0 - torchvision:0.8.0 - cudatoolkit:10.2.89 - cudnn:7.6.5
  • MATLAB数学.rar
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    简介:该资源为MATLAB数学建模工具包压缩文件,包含用于数据分析、算法开发和数值计算等数学建模所需的各类函数与示例代码。 Matlab数学建模工具箱包含三部分内容(支持平台为MATLAB5.3或5.2版本),包括Symbolic math、optim、spline、stats模块: 1. 提供了常用数学建模工具的中文帮助文档。 2. 包含了一些标记有星号的重要贡献的MATLAB数学建模工具。 3. 收录了中国大学生数学建模竞赛历年试题的相关MATLAB程序。
  • 3DMax软( Hose Tool)
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    Hose Tool是专为3D Max设计的一款高效建模插件,主要用于创建各种复杂弯曲的管道和软管模型,极大简化了相关场景的设计流程。 3ds Max软管一键建模工具。
  • 支架的SolidWorks和Abaqus仿真
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    本项目聚焦于利用SolidWorks进行血管支架的设计与绘图,并通过Abaqus软件开展详细的力学仿真分析,旨在优化支架性能并确保其生物相容性和机械稳定性。 solidworks和abaqus在血管支架的建模仿真中的应用。
  • VMTK教程指南
    优质
    《VMTK教程指南》是一本详细介绍血管医学成像和建模工具包(VMTK)使用方法的手册,旨在帮助用户掌握其在医学图像处理中的应用技巧。 我整理了一份关于VMTK的文档,详细介绍了如何使用这一开源C++库进行血管结构的分割、提取与分析。VMTK基于ITK和VTK开发,适用于对三维医学图像处理感兴趣的用户深入研究。