
自动细胞计数器:基于Python的Automatic-Cell-Counter
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简介:
Automatic-Cell-Counter是一款利用Python开发的自动细胞计数工具。它能够高效准确地对显微图像中的细胞进行识别与计数,适用于生物医学研究和实验室工作流程自动化。
自动细胞计数器是一种利用算法来自动化计算图像中的细胞数量的工具,并提供一个用户界面以供手动校正结果。
安装步骤如下:
该算法使用Python 3.7编写,为运行此框架,请先通过执行命令`pip install -r requirements.txt` 安装必需的软件包。如果您是conda用户,则首先需要通过 `conda install pip` 来安装pip。
用法说明:
要启动细胞计数器,只需在终端中输入以下代码即可。
所需参数:-image:指定路径至单张图像或包含多张图片的文件夹。
例如: python viewer.py --image example_data/8.tif 或者 python viewer.py --image example_data/
使用示例输出结果:
对于每个输入的图像,系统会自动生成一个用户界面以供手动校正。在这个界面上,每一个检测到的细胞都会用红色标记点表示。
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