Advertisement

HiC工具箱:Hi-C数据分析工具集

  •  5星
  •     浏览量: 0
  •     大小:None
  •      文件类型:ZIP


简介:
简介:HiC工具箱是一款全面的软件集合,专为简化和加速Hi-C数据的分析流程而设计。它提供了从数据预处理到高级建模的一站式解决方案,助力研究人员更高效地探索染色质三维结构与基因调控机制之间的关系。 Juicer是一个Java完整管道工具,用于将原始读取数据转换为Hi-C映射,并在Juicebox软件中进行可视化展示。它能够调用域、循环以及CTCF结合位点。此外,该工具支持.hic文件格式来存储多分辨率的Hi-C数据。

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~
客服
客服
  • HiCHi-C
    优质
    简介:HiC工具箱是一款全面的软件集合,专为简化和加速Hi-C数据的分析流程而设计。它提供了从数据预处理到高级建模的一站式解决方案,助力研究人员更高效地探索染色质三维结构与基因调控机制之间的关系。 Juicer是一个Java完整管道工具,用于将原始读取数据转换为Hi-C映射,并在Juicebox软件中进行可视化展示。它能够调用域、循环以及CTCF结合位点。此外,该工具支持.hic文件格式来存储多分辨率的Hi-C数据。
  • 包络(DEA) for MATLAB
    优质
    数据包络分析(DEA)工具箱 for MATLAB是一款专为MATLAB设计的应用程序,用于执行效率和生产率分析。此工具箱提供了多种DEA模型来评估决策单元(如组织或部门)的相对有效性,并支持灵活性的数据输入与直观的结果展示。它是进行运营管理、绩效评价及资源分配的理想选择。 DEA 数据包络分析工具箱 是一个用于MATLAB的数据包络分析工具箱。
  • Matlab 时频_时频_matlab_时频
    优质
    MATLAB时频分析工具箱提供了一系列用于信号处理和分析的强大函数,适用于进行时间-频率表示、谱估计等任务,是研究非平稳信号的理想选择。 Matlab时频分析工具箱包含常用的时频分析函数。
  • 与MATLAB
    优质
    《分形数据与MATLAB工具箱》是一本专注于利用MATLAB进行分形分析和建模的实用指南,适用于科研人员及工程技术人员。书中详细介绍了如何使用MATLAB的强大功能来生成、分析并可视化复杂的分形图案,并提供了丰富的案例研究和练习题,帮助读者深入理解这一领域的核心概念与应用技巧。 这段文字包含了一些用于分形图形仿真的MATLAB代码以及我自己搜集的相关资料,希望能对大家有所帮助。
  • SIMULINK(zip文件)_fotf_ninteger_
    优质
    本资源提供SIMULINK环境下使用的分数阶系统建模与仿真工具箱(zip格式),内含基于fotf和ninteger库的高级函数,助力复杂分数阶系统的分析。 在MATLAB中有两个分数阶工具箱:一个是ninteger工具箱,另一个是FOTF。
  • LSSVM.rar_LSSVM MATLAB_LSSVM_lssvm的_
    优质
    本资源提供了一个全面的LSSVM(最小二乘支持向量机)MATLAB工具箱,适用于各类机器学习任务。此工具箱能够帮助用户便捷地进行数据处理、模型训练及预测分析等工作,是科研人员和工程师的理想选择。 基于MATLAB的神经网络工具箱安装后即可使用。
  • MATLAB文档.doc
    优质
    本文件为《MATLAB数据采集工具箱文档》,详细介绍了如何利用MATLAB进行硬件设备的数据采集、处理及分析,适用于科研与工程领域。 MATLAB数据采集工具箱文档提供了关于如何使用MATLAB进行数据采集的详细指导和教程。该文档涵盖了一系列的数据采集方法和技术,并为用户提供了解决实际问题的具体示例与代码。通过阅读这份文档,用户可以更好地掌握利用MATLAB实现高效、精确的数据收集流程所需的知识技能。
  • 图吧合(图拉丁
    优质
    图吧工具箱集合是一款结合了众多实用功能的应用程序,其中包含了图拉丁工具箱的各项强大工具。它为用户提供了一系列便捷的操作选项,方便用户进行各种图片处理和管理活动。无论是图片裁剪、压缩还是格式转换,这款合集都能满足你的需求。 本资源包含图吧工具箱合集,可以检查系统硬件情况、测试硬盘性能、整理磁盘碎片、测试固态硬盘速度、进行CPU与显卡超频操作以及数据恢复等实用功能。此外还支持磁盘分区等功能,整体来说非常强大且经过防病毒处理,杀毒软件不会报毒,保证安全无毒。欢迎下载使用。
  • MATLAB时频
    优质
    MATLAB时频分析工具箱提供了丰富的函数和应用程序,用于计算、绘制与时频分析相关的各种信号表示。它支持短时傅里叶变换、Wigner-Ville分布等多种方法,助力深入研究非平稳信号特性。 1. 下载并解压文件后,请将其放置在MATLAB的toolbox工作路径下。 2. 打开MATLAB软件,依次选择File -> Set Path -> Add with Subfolders,然后找到你刚才下载的工具箱(tftb-0.2),点击进入之后保存设置并关闭窗口。 3. 此时请将work文件夹下的tftb-0.2作为工作路径使用。 4. 最后,在Command Window中输入命令mex -setup,并回车选择C++项。
  • MATLAB时频
    优质
    MATLAB时频分析工具箱提供了一系列算法和可视化工具,用于信号处理中的时频分析。它支持小波变换、Wigner-Ville分布等技术,帮助用户深入理解非平稳信号特征。 在MATLAB中进行时频分析是信号处理中的一个重要技术手段,它能够揭示出非平稳信号的时间变化频率特性。本资源“matlab时频分析函数箱”提供了一系列用于执行此类分析的专用函数与代码,旨在帮助用户更好地理解和应用相关理论。 传统傅立叶变换的一个局限在于无法同时获取信号在时间和频率两个维度上的信息。而在MATLAB中进行时频分析,则可以采用多种方法来克服这一问题,包括但不限于短时傅里叶变换(STFT)、小波变换以及拉普拉斯变换等: 1. 短时傅立叶变换:通过将时间序列分割成若干片段并计算每个片段的傅立叶谱图以获得局部频域信息。MATLAB中的`stft`函数可以执行该操作,同时使用`plot`或`imagesc`来展示结果。 2. 小波分析:这种方法能够灵活地在不同尺度和位置上考察信号频率成分的变化情况。MATLAB提供了包括但不限于`wavemngr`, `wavedec`, 和 `waverec`在内的多个函数用于执行小波分解与重构,而`wplot`则可以用来可视化这些系数。 3. 拉普拉斯变换:适用于滤波和系统分析的另一种时频方法。MATLAB中的`laplace`及它的逆变换函数`ilaplace`分别负责拉普拉斯正反向转换的操作。 4. 多尺度技术:除了上述提到的方法外,还有其他如Gabor变换、Mallat算法等多分辨率处理手段可供选择,在MATLAB中可以通过编写自定义脚本或使用第三方工具箱来实现这些高级分析方法。 5. SIFT(Scale-Invariant Feature Transform): 虽然SIFT最初是为图像特征提取而设计的,但在某些时频场景下也可以发挥作用。在MATLAB环境中可能存在相应的SIFT算法实现方式,这使得信号的关键特性可以在不同时间和频率尺度上被识别和处理。 此“matlab时频分析工具箱”可能包括上述函数的具体实现代码、示例及教程等资源以支持用户快速入门并开展复杂信号的深入研究。通过掌握这些技术,并结合实际问题进行实践操作,可以显著提高在该领域的专业水平。同时建议读者参考MATLAB官方文档来获取最准确和最新的相关信息和支持材料。 时频分析方法广泛应用于通信、生物医学工程及地震学等多个领域中,因此熟练运用这些工具箱将有助于解决各种非平稳信号的复杂问题。