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(源码)利用Python构建遗传疾病与个人特征知识图谱的整合.zip

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简介：
本项目旨在通过Python开发一个遗传疾病和个人特征的知识图谱，实现遗传信息和个体特性的数据整合及分析。 ## 项目简介 本项目基于OMIM疾病及表型数据、HPO人类表型数据、GWAS个体特征研究报告数据以及PubMed中的基因、疾病与表型相关论文文本，构建了遗传疾病和个体特征的知识图谱，并将该图谱与之前开发的药物基因组知识图谱进行了节点融合。最终形成的综合图谱包含超过234万个节点，486万条关系边及2162万个属性。 ## 项目的主要特性和功能 - 知识图谱构建：基于OMIM、HPO、GWAS以及PubMed数据建立了遗传疾病和个体特征的知识图谱。 - 节点融合：实现了遗传疾病与个体特征知识图谱同药物基因组知识图谱之间的节点关联，使跨图的基因信息得以整合。 - 数据清洗与整理：对上传至Neo4j的数据文件进行了清理及组织工作，确保数据准确性和完整性。 - 图谱分析：通过统计和可视化手段展示了图谱中的关键信息，并提供了详细的节点和关系数据分析。

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  • (源码)利用Python构建遗传疾病与个人特征知识图谱的整合.zip
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    本项目旨在通过Python开发一个遗传疾病和个人特征的知识图谱，实现遗传信息和个体特性的数据整合及分析。 ## 项目简介 本项目基于OMIM疾病及表型数据、HPO人类表型数据、GWAS个体特征研究报告数据以及PubMed中的基因、疾病与表型相关论文文本，构建了遗传疾病和个体特征的知识图谱，并将该图谱与之前开发的药物基因组知识图谱进行了节点融合。最终形成的综合图谱包含超过234万个节点，486万条关系边及2162万个属性。 ## 项目的主要特性和功能 - 知识图谱构建：基于OMIM、HPO、GWAS以及PubMed数据建立了遗传疾病和个体特征的知识图谱。 - 节点融合：实现了遗传疾病与个体特征知识图谱同药物基因组知识图谱之间的节点关联，使跨图的基因信息得以整合。 - 数据清洗与整理：对上传至Neo4j的数据文件进行了清理及组织工作，确保数据准确性和完整性。 - 图谱分析：通过统计和可视化手段展示了图谱中的关键信息，并提供了详细的节点和关系数据分析。
     
  • Python利用知识图谱构建的问答系统.zip
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    本项目旨在开发一个基于Python的知识图谱驱动型智能问答系统，通过结构化数据解析和自然语言处理技术提供精准答案。 在IT行业中，知识图谱是一种高效的信息组织与检索方式，在问答系统（QA系统）的应用尤为广泛，它能够帮助机器理解并处理复杂的查询。基于Python的知识图谱QA系统的开发重点在于如何利用该编程语言构建这样的应用体系。由于其易学性及强大的功能支持，加上丰富的库资源和活跃的社区环境，使得Python成为此类项目中的理想选择。 要建立一个基于知识图谱的问答系统，首要任务是掌握知识图谱的基本概念：这是一个以图形方式表示实体（如人物、地点或事件）及其相互关系的知识存储结构。在使用Python进行开发时，可以利用NetworkX或Graphviz等库来创建和展示这些复杂的关系网络。 接下来需要收集数据填充这一知识体系，这可能包括从百科全书、数据库或者特定领域获取的信息资源。在此过程中，BeautifulSoup和Scrapy这样的网页抓取工具以及pandas的数据处理功能将大有帮助。 完成图谱构建后，下一步就是实现问答机制了。该步骤涉及自然语言处理（NLP）技术的应用，如词法分析、句法解析及语义理解等环节。Python的NLTK库和spaCy是提供这类服务的有效工具；而Stanford CoreNLP或Hugging Face Transformers则可以作为更高级别的解决方案。 对于查询匹配部分，则可能需要使用字符串匹配、关键词提取或者通过Word2Vec或BERT嵌入进行的语义相似度计算等方法。这些技术能够帮助系统理解用户的问题，并找到最相关的答案。 一旦确定了潜在的答案，还需要进一步评估和排序它们的相关性与准确性。这通常涉及到机器学习算法的应用，比如RankSVM或是基于深度学习的方法。Python中的scikit-learn库提供了多种机器学习模型的选择；而TensorFlow或PyTorch则可以用来开发更复杂的深度学习架构。 考虑到系统的可扩展性和性能优化方面，在存储和检索大规模的知识图谱时使用Elasticsearch或Apache Lucene等工具将有助于提高查询效率。 最后，为了测试并持续改进这个问答系统，需要建立有效的评估框架。准确率、召回率及F1分数可以作为衡量其表现的关键指标；同时不断进行在线学习以及收集用户反馈也是提升整体质量的重要环节。 基于Python的知识图谱QA系统的开发涵盖了多个技术领域：包括但不限于Python编程、网络数据抓取、自然语言处理、知识图谱构建与查询匹配，机器学习及性能优化。通过深入研究并实践这些技能组合，开发者能够创建出具备理解和回答复杂问题能力的智能系统。
     
  • 利用Python构建中成药的Neo4j知识图谱
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    本项目运用Python语言搭建了一个针对中成药的知识图谱，采用Neo4j数据库存储和展示药物之间的复杂关系网络。 知识图谱是一种结构化的数据表示形式，用于存储和管理复杂的数据关系。在本项目中，我们专注于构建一个基于Python的中成药知识图谱，并使用Neo4j作为图数据库来获取和展示数据。 1. **知识图谱的概念与应用**： 知识图谱是现代信息处理的关键技术之一，它通过图形的形式表示实体（如中成药、药材、疾病等）及其相互关系。在医药领域，知识图谱能够帮助医生快速查找药物信息，并发现潜在的药物相互作用，从而提高诊疗效率。 2. **Python在知识图谱中的角色**： Python是数据科学和图分析的主要语言之一，拥有丰富的库如NetworkX、Graph-tool等用于构建和操作图。本项目中，我们将使用Python编写爬虫程序来抓取中成药的数据，并通过与Neo4j的交互进行数据分析。 3. **Neo4j图数据库**： Neo4j是一款高性能的图形数据库，特别适合存储复杂关系数据。在我们的知识图谱里，它将用于存储药品名称、成分等信息及其之间的关联性。 4. **爬虫技术**： 爬虫是自动获取网络数据的程序，在构建知识图谱时需要从各类在线资源中提取相关药物的信息。Python中的BeautifulSoup和Scrapy库可以高效地解析HTML并提取所需的数据。 5. **数据预处理与清洗**： 从网上爬取到的数据通常需要进行清洗，去除无关信息、标准化格式以及填补缺失值等操作以确保数据质量。我们使用Pandas等工具来进行这些步骤，以便于后续导入Neo4j数据库的操作。 6. **导入数据至Neo4j**： 使用Cypher语言将预处理后的数据导入到图数据库中是必要的一步。通过Python的neo4j-driver库编写脚本批量创建节点和关系可以实现这一目的。 7. **可视化**： 可视化对于理解知识图谱结构至关重要，我们可以通过Gephi或Neo4j自带浏览器插件来展示这些信息，并使用布局算法如Fruchterman-Reingold或ForceAtlas2等帮助直观地看到中成药之间的关联网络。 8. **查询与分析**： 利用Cypher语言进行深度挖掘是可能的，例如查找含有特定药材的所有药品或者具有某种疗效的药物组合。结合Python可以实现动态查询和分析功能，为医药研究提供支持。 9. **挑战与优化**： 在项目实施过程中可能会遇到数据质量问题、性能下降等问题，这些问题需要通过严格的校验机制及数据库索引等技术手段来解决以确保图谱的质量和效率。 通过这个项目，我们能够创建一个全面且实时的中成药知识图谱，为医疗决策提供有力的数据支持，并为广大用户提供药品信息查询服务。
     
  • (源码)利用Python和LLM构建知识图谱及问答系统的代码.zip
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    本资源提供了一个基于Python与大语言模型（LLM）构建的知识图谱及问答系统完整代码包。通过此项目，用户可以深入了解如何运用现代技术实现智能问答应用开发。 ## 项目简介 本项目是一个基于Python和大型语言模型（LLM）的知识图谱构建与问答系统。通过解析文本和图像数据，系统能够自动提取实体、关系及图像信息，并利用LLM进行进一步优化和增强。该系统旨在帮助用户快速获取并理解复杂文档或数据集中的关键信息。 ## 项目的主要特性和功能 1. 知识图谱构建：从文本与图像中自动抽取实体及其相互间的关系，形成知识图谱，使用户能够迅速掌握数据核心内容及关联性。 2. 问答系统：提供一个界面供用户提问以获取相关知识图谱信息，为用户提供直观便捷的数据检索途径。 3. 多模态处理能力：可以同时处理文本和图像资料，并从中提取多维度的信息构建更加全面的知识网络。 4. LLM集成功能：整合大型语言模型来改进实体及关系的识别效果，从而提高整个知识结构的质量与深度。
     
  • 中医与人工智能——利用Protégé构建知识图谱
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    本研究探讨了在中医领域应用人工智能技术的方法和前景。通过使用Protégé工具来构建医学知识图谱，以期实现中医药知识的有效管理、共享及智能化服务，促进中医学的现代化发展。 本段落介绍了中医与人工智能的结合，并详细描述了如何使用Protégé工具来构建知识图谱。通过这一方法，可以更好地利用现代技术手段促进中医药学的发展和应用。
     
  • Python中的知识图谱构建代码
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    本段落介绍如何使用Python语言来实现知识图谱的构建，包括相关库的引入、数据预处理、实体与关系抽取以及图数据库的操作等步骤。 知识图谱是一种结构化的数据表示形式，用于存储、管理和理解复杂的数据集合。在Python编程环境中构建知识图谱涉及对数据处理、图形数据理解和算法实现的掌握。 项目提供的文件包括： 1. 数据文件解析： - `公司_经营范围关系.csv`：此文档可能包含企业基本信息及其业务领域的关联信息。 - `公司实体.csv`：这个文件记录了企业的基础资料，如ID和名称等，是构建知识图谱的重要部分。 - `node_attribute.csv`：该文件包含了节点的各种属性数据，例如类型、值等。 - `节点2.csv`：可能包含更多类型的节点，比如人或地点的实体信息。 - `hot.csv`：此文档可能是基于某些指标筛选出的关键节点列表。 - `边2无向.csv`和`边2有向.csv`：这些文件描述了图中的连接关系，分别代表双向和单向的关系。 2. 代码解析： - `hot.py`：可能包含了用于计算节点重要性的算法或函数。 - `kg_generator.py`：此脚本负责读取数据、构建知识图谱以及执行图形操作功能。 - `data_loader.py`：该文件处理加载与预处理数据的任务，将CSV格式的数据转换为适合图结构的形式。 3. Python中的知识图谱创建： 在Python环境中，常用库如NetworkX和PyTorch Geometric可以用于构建和管理复杂的图。通常，在完成数据读取后，会先建立节点再根据边的文件添加连接关系，并可能包含关于节点属性的信息编码等步骤。 4. 知识图谱的应用场景： 知识图谱广泛应用于多个领域，如智能问答系统、推荐引擎及企业间的关系分析等方面。通过分析这些结构化的数据模型可以揭示隐藏的数据模式和社区间的关联性。 5. 图算法的使用： 项目中可能涉及到多种图形算法的应用，例如最短路径搜索（Dijkstra或Floyd-Warshall），重要节点识别（如PageRank）以及社群检测等方法。 6. 数据可视化： 为了更好地展示知识图谱的内容并进行分析，还可以利用matplotlib、seaborn和networkx库中的绘图工具将数据以图形化方式呈现出来。
     
  • (源码)利用Python构建中文心理健康知识图谱系统的代码.zip
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    本资源提供了一个使用Python编写的完整项目源码，用于创建和管理一个针对中文用户的心理健康知识图谱系统。包含数据预处理、模型训练及交互式查询等模块的实现代码。 ## 安装使用步骤 本项目是一个基于Python的中文心理健康知识图谱构建系统，旨在通过整理和分析心理健康相关的疾病数据来创建一个结构化的知识图谱。该系统涵盖了241种与心理健康有关的疾病，并提供了详细的疾病属性信息，包括但不限于疾病名称、症状、治疗选项等。使用此工具可以方便地查询并深入研究各种心理健康的病症情况。 项目主要特点及功能如下： 1. 疾病数据管理系统：提供涉及多种类别的241个心理健康相关疾病的详尽资料。 2. 属性信息检索：每个疾病条目都包含了多个重要属性，例如症状、治疗方法等，以便于用户进行快速查询和详细分析。 3. 知识图谱生成能力：能够将收集到的疾病数据转换成易于理解的知识图表形式，有助于进一步的知识推断与关联性研究工作开展。 4. 数据分类及索引服务：依据DSM5标准对所有信息进行了系统化整理，并允许用户根据特定类别或关键词快速检索所需内容。
     
  • Python-Zincbase：一个用于构建知识图谱的工具包
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    Python-Zincbase是一款专为开发者设计的知识图谱构建工具包。它利用Python语言的优势，提供高效、灵活的知识存储和查询服务，助力于数据驱动的应用开发与研究。 Zincbase 是一个用于构建知识图谱的工具包。
     
  • 基于知识图谱的疾病知识问答系统的Java毕设源码及项目说明.zip
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    本压缩包包含一个基于Java编写的毕业设计项目源代码和文档，该项目构建了一个利用知识图谱进行疾病相关问题自动回答的系统。 【资源说明】Java毕设基于知识图谱的疾病知识问答系统源码+项目说明.zip 1. 实体类型 | 实体类型 | 中文含义 | 实体数量 | 举例 | | ---------- | -------- | ----------- | ---- | | Disease | 疾病 | 8792 | 感冒 | | Department| 科室 | 54 | 内科 | | Check | 检查项目 | 3342 | 血常规| | Drug | 治疗药品 | 1204 | 布洛芬片| | Food | 食物 | 4854 | 蜂蜜 | | Symptom | 症状 | 6556 | 腹腔积血 | | Total | 总计 | 24802 | 约2.5万实体 | ### 实体关系三元组 - ``：疾病所属科室 - ``：疾病检查项目 - ``：疾病常用药物 - ``：疾病症状 - ``：疾病宜吃食物 - ``：疾病忌吃食物 - ``：推荐食谱 - ``：疾病并发症 ### 实体关系信息 | 实体关系类型 | 中文含义 | 关系数量 | 示例 | | -------------- | ----------- | ------------------- | ------------------------------------------------------------------------| | belongs_to | 属于 | 8784 | <哮喘,belongs_to,内科> | | common_drug | 常用药物 | 13477 | <小儿肺炎，common_drug，小儿肺热平胶囊> | | good_food | 宜吃食物 | 34221 | <胸椎骨折,good_food,黑鱼> | | avoid_food | 忌吃食物 | 34215 | <感冒,avoid_food,猪油> | | check_item | 检查项目 | 39098 | <肾结石,check_item，尿液颜色> | | recommand_recipes| 推荐食谱 | 39663 | <肝病,recommand_recipes,芝麻小米粥> | | has_complication | 并发症 | 19151 | <痔疮,has_complication,直肠癌> | | has_symptom | 疾病症状 | 58398 | <冠心病,has_symptom,心慌；呼吸困难；心力衰竭> | ### 总计 近25万实体关系 该资源内项目代码都经过测试运行成功，功能正常的情况下才上传的，请放心下载使用！本项目适合计算机相关专业(如计科、人工智能、通信工程、自动化、电子信息等)的在校学生、老师或者企业员工下载使用，也适合小白学习进阶。当然也可作为毕设项目、课程设计或作业使用。如果基础还行，也可以在此代码基础上进行修改以实现其他功能，并可直接用于毕业设计或课程设计中。 欢迎下载并沟通交流，互相学习共同进步！