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TDA教程:一组使用Python Gudhi库以及常用机器学习和数据科学库,用于实践TDA的Jupyter Notebook。

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简介:
拓扑数据分析(TDA)作为一项新兴且快速发展的领域,致力于提供一套全新的拓扑和几何工具,旨在揭示可能隐藏在复杂数据中的关联特征。本教程通过Python Gudhi库,并结合了广泛使用的机器学习和数据科学库,构建了一系列实践笔记本,以阐明TDA的应用。例如,您可以参考相关资料以深入了解数据科学领域中TDA的原理。此外,完整的笔记本列表也位于本页的结尾部分。为了安装Python Gudhi库,您可以参考提供的指南,或者如果您使用conda环境,则可以直接进行安装。TDA分析管道通常专注于从网络点云中提取拓扑特征,这些特征往往存在于一般指标空间中。 实际上,通过研究点云的拓扑特性,我们指的是研究以点云为中心的球的并集的拓扑结构——也称为偏移量。然而,非离散集(如偏移量)以及连续的数学形状(例如曲线、曲面和更广泛的流形)难以直接转化为有限的离散结构进行编码。因此,在计算几何学中常常采用形的方法来近似这些形状。单纯形复数则是一种集合形式……

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  • TDA:利Python Gudhi进行TDAJupyter Notebook集合
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    本教程是一系列基于Jupyter Notebook的学习材料,旨在教授如何使用Python的Gudhi库及其他数据科学工具来进行拓扑数据分析(TDA)的实际操作。适合希望掌握TDA技术的数据科学家和研究人员。 拓扑数据分析(TDA)是一个新兴且发展迅速的领域,提供了一组新的拓扑和几何工具来推断复杂数据的相关特征。在这里,我们使用Python Gudhi库以及流行的机器学习库和数据科学库为TDA的应用提出了一系列教程。 在进行TDA分析时,通常的目标是从点云中提取拓扑特性。这些点可以存在于网络中的任何位置或更广泛的度量空间内。当我们说研究点云的拓扑性质时,我们实际上是在探讨围绕每个点的球体集合(称为偏移)所形成的总体结构。 然而,在计算几何学中处理连续数学形状(例如曲线、曲面和流形等),由于非离散集或连续形式无法直接转换为有限的离散模型。因此,通常采用单纯复形来近似这些复杂的形状与空间关系。简单来说,单纯复形是一组点及其连接构成的基本几何单元集合,它能够有效地捕捉到原始数据中的拓扑信息和结构特征。 使用Gudhi库进行TDA分析的一个重要步骤就是构建所谓的“单纯形树”,这有助于我们对复杂的数据集执行高效的计算,并从中提取有意义的拓扑特性。
  • sklearn-tda:融合TDA开源工具
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    sklearn-tda是一款结合了拓扑数据分析(TDA)和机器学习技术的Python开源库,旨在为数据科学家提供强大的特征提取及模式识别工具。 **sklearn-tda:适用于机器学习和TDA的scikit-learn兼容Python软件包** 作者:Mathieu Carrière 警告:此代码已不再维护,因为它现在已成为Gudhi库的一部分(Mapper和Tomato模块除外)。建议任何希望使用该代码的人参考Gudhi。 **描述** sklearn_tda是一个Python软件包,用于为机器学习目的处理持久性图的集合。它实现了多种预处理方法、矢量化方法以及内核函数,并且以兼容scikit-learn的方式实现。此外,还提供了一些来自TDA(拓扑数据分析)中的聚类算法(如Mapper和ToMATo)。 **前处理** 当前可用的类包括: 1. **BirthPersistenceTransform:** 对图应用仿射变换。(x, y) -> (x, y * x) 2. **DiagramScaler:** 将缩放器应用于图表,例如进行标准化。
  • Python词云:在Jupyter NotebookPython使
    优质
    本教程详细介绍如何利用Python的词云库创建美观的数据可视化效果,并展示其在Jupyter Notebook及Python应用程序中的实际应用场景。 word_cloud 是一个用于数据科学家的词云可视化的库,在Jupyter笔记本中可以使用它从Web应用程序等来源生成词云。 产品特点包括: - 生成单个文档的词云。 - 使用文档列表生成词云。 - 对已经定义分数的单词或短语生成词云。 - 嵌入到Jupyter笔记本并在HTML页面上显示随机颜色。 快速开始:使用pip安装word_cloud ```python pip install git+ssh://git@github.com/kavgan/word_cloud.git ``` 实例化WordCloud,获取单词云的HTML代码并显示: ```python from word_cloud.word_cloud_generator import WordCloud # 示例代码 wc = WordCloud() html_code = wc.get_html() display(html_code) ```
  • TDA风格初音未来(Miku)【Mikumikudance】
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    这段简介描述的是以TDA(Total Drum Array)音乐风格为背景设计的虚拟歌手初音未来的形象,特别适合在MMD(Mikumikudance)软件中使用。 TDA式MIKU禁止二次分发,并且不得用于任何商业活动中使用。同时也不允许在R18视频中使用或将其改造为其他样式模型。可以将服装中的单独部件取出并应用于其他PD模型上,但非PD模型不可使用。 静画和动画的使用是可以接受的,但是必须注明配布者的名字以及模型名称,并且需要投稿到nico、nico静画或者mikumikudance吧等相关平台。所有使用者都必须严格遵守上述规定。
  • TDA Thread Dump Analyzer - tda-bin-2.3.3.zip
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  • Pytorch深度(六):使Diabetes
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    本文为《PyTorch深度学习实践》系列文章之一,在本篇中将利用PyTorch框架结合糖尿病数据集进行实际的机器学习操作,帮助读者理解如何应用PyTorch解决真实世界中的问题。 1. 机器学习入门 2. PyTorch介绍 3. 数据已经分类好,并且有标签,可以配合相关博文一起阅读。
  • 笔记本:Jupyter Notebook
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    《笔记本:Jupyter Notebook与数据科学实例》一书通过丰富的案例讲解了如何利用Jupyter Notebook进行高效的数据分析和科学计算,是数据科学家和技术爱好者的实用指南。 Jupyter笔记本示例使用numpy和pandas库的Jupyter Notebook入门示例。 要求安装: - Python 3 - NumPy - Pandas Jupyter笔记本用法: 1. 克隆仓库到本地:`git clone https://github.com/jamilnyc/notebooks.git` 2. 进入目录:`cd notebooks/` 3. 启动Jupyter Notebook服务:`jupyter notebook` 导航到最后一个命令打印的地址,然后打开一个*.ipynb文件。 intro.ipynb笔记本是一个不错的起点。 任务: - 使用更多可以在笔记本中执行的操作示例,使intro.ipynb笔记本更加通用。 - 创建指向软件要求安装指南的链接 - 制作一个专注于array类型的n的新示例
  • Intel RealSense 深度相使 Jupyter Notebook
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    本教程教授如何利用Jupyter Notebook与Intel RealSense深度相机进行交互,涵盖基本设置、数据采集及处理等步骤,适合编程初学者。 Intel Realsense 深度相机教程基于 Jupyter Notebook 编写。该教程旨在帮助用户了解如何使用 Intel RealSense 相机进行深度感知,并通过 Jupyter Notebook 进行实践操作,涵盖安装步骤、基本功能介绍以及实际应用案例等内容。
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    简介:Jupyter Notebook是一款支持实时编码、文档编写与数据可视化于一体的交互式开发环境,广泛应用于数据分析和科学计算领域。 ### Jupyter Notebook使用指南 #### 一、Jupyter Notebook介绍 Jupyter项目是一个非盈利的开源项目,起源于2014年的ipython项目,并逐渐发展为支持跨所有编程语言的交互式数据科学和科学计算工具。 #### 二、为什么使用Jupyter Notebook? 对比Jupyter Notebook与Pycharm #### 三、Jupyter Notebook的使用 3.1 界面启动及创建文件 3.2 cell操作 3.3 markdown演示 #### 四、Jupyter Notebook中自动补全代码等相关功能拓展【了解】