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DeepLabCut:无标记深度学习在动物姿态估计和行为跟踪中的应用-含Python源码

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简介:
《DeepLabCut》是一部介绍如何利用无标记深度学习技术进行动物姿态估计与行为跟踪的研究著作。书中提供了详细的Python源代码,帮助读者深入理解和实践这一前沿技术。 DeepLabCut 是一个工具箱,用于对执行各种任务的动物进行无标记姿势估计,并且现在支持多动物姿态估计(测试版)。该文档提供了安装指导、过程概述以及项目管理的管道和工作流程介绍。我们还提供了一个 Nature Protocols 论文中的分步用户指南。 演示代码方面,我们准备了几个 Jupyter Notebook:一个引导您使用演示数据集来验证您的 DeepLabCut 安装是否正确;另一个则帮助您在自己的数据上运行该工具箱。此外,我们也展示了如何在 Docker 和 Google Colab 上操作这些代码。 为什么要选择 DeepLabCut?2018 年时我们证明了它能够追踪果蝇的各种行为,包括它们的觅食、内部导航以及产卵过程中的动作(详见 Mathis 等人的研究)。然而,该工具箱并非专门针对特定任务或物种设计。因此,DeepLabCut 可以适用于广泛的动物姿势估计和行为跟踪应用中。

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客服
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  • DeepLabCut姿-Python
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    《DeepLabCut》是一部介绍如何利用无标记深度学习技术进行动物姿态估计与行为跟踪的研究著作。书中提供了详细的Python源代码,帮助读者深入理解和实践这一前沿技术。 DeepLabCut 是一个工具箱,用于对执行各种任务的动物进行无标记姿势估计,并且现在支持多动物姿态估计(测试版)。该文档提供了安装指导、过程概述以及项目管理的管道和工作流程介绍。我们还提供了一个 Nature Protocols 论文中的分步用户指南。 演示代码方面,我们准备了几个 Jupyter Notebook:一个引导您使用演示数据集来验证您的 DeepLabCut 安装是否正确;另一个则帮助您在自己的数据上运行该工具箱。此外,我们也展示了如何在 Docker 和 Google Colab 上操作这些代码。 为什么要选择 DeepLabCut?2018 年时我们证明了它能够追踪果蝇的各种行为,包括它们的觅食、内部导航以及产卵过程中的动作(详见 Mathis 等人的研究)。然而,该工具箱并非专门针对特定任务或物种设计。因此,DeepLabCut 可以适用于广泛的动物姿势估计和行为跟踪应用中。
  • Python-DeepLabCut姿
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    Python-DeepLabCut是一款基于深度学习技术的开源软件工具包,专门用于动物姿态估计及行为追踪分析。通过创新性的无标记点方法,它能够精准识别并跟踪实验对象的动作,极大地简化了生物医学、神经科学等领域的研究工作流程,并提升了数据处理和分析效率。 DeepLabCut是一种无需标记的深度学习方法,用于动物姿态估计与行为跟踪。
  • DeepLabCut: 正式实现——通过对所有户定义特征姿
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    DeepLabCut是一款利用深度学习技术进行无标记、用户自定义特征识别的软件工具,特别适用于各类动物的姿态分析。 DeepLabCut 是一个用于估计执行各种任务的动物姿势的无标记工具箱。只要您能看到需要跟踪的对象(即进行了标记),就可以使用此工具箱,因为它与特定的动物或物体无关。 最近更新包括: - 支持多动物姿态估算功能已上线(BETA版本,请提供反馈!pip install deeplabcut==2.2b8)。 - 实时软件包现已推出! 快速安装命令:`pip install deeplabcut` 此外,您还需要安装tensorflow和wxPython。有关项目管理和工作流程的概述以及详细的用户指南,请查阅相关文档。 为了更深入地了解工具箱的功能及其应用,请参考提供的详细资料。
  • 关于人体姿综述.pdf
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    本文为一篇关于深度学习在人体姿态估计领域应用的综述性文章,全面总结了当前该领域的研究进展、技术方法及面临的挑战,并展望未来的发展方向。 本段落综述了基于深度学习的人体姿态估计方法的研究进展。文章首先介绍了人体姿态估计的基本概念及其在计算机视觉领域中的重要性,随后详细回顾了近年来利用深度学习技术进行人体姿态估计的代表性工作和技术路线,并对各种方法进行了分类和对比分析。最后,探讨了该领域的未来研究方向和发展趋势。
  • 基于轻量化OpenPose模型多人实时姿
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    本研究提出了一种优化版的OpenPose模型,适用于实时环境下的多人姿态识别和追踪任务,特别针对计算资源有限的应用场景进行改进。通过减少模型复杂度及参数数量,实现在保证准确性的同时显著提高处理效率和速度。 一个轻量化模型在经典OpenPose基础上进行了改进,适用于多人实时姿态估计,并能记录每个人的ID进行跟踪。该深度学习模型的网络结构简单化,便于集成到Python或C++环境中,非常适合计算机视觉研究者深入探索。
  • 关于视觉多目综述.pdf
    优质
    本文为一篇关于深度学习技术在视觉多目标跟踪领域应用的研究综述。文章深入分析了现有方法的优势与不足,并探讨了未来研究方向。 本段落综述了基于深度学习的视觉多目标跟踪算法的研究进展。文章首先介绍了多目标跟踪的基本概念及其在计算机视觉领域的应用价值,并详细回顾了几种主流的深度学习方法,包括但不限于孪生网络、关联记忆模型以及端到端可训练架构等。此外,文中还分析了当前技术所面临的挑战和未来的发展趋势。 对于研究者而言,该综述文章提供了一个全面了解多目标跟踪领域最新进展的机会,并为从事相关工作的学者提供了宝贵的参考资源。
  • 算法综述.pdf
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    本文为《目标跟踪算法在深度学习中的综述》撰写简介如下: 该论文全面回顾了基于深度学习的目标跟踪算法的发展历程、关键技术及应用现状,深入分析其优势与挑战,并对未来的研究方向进行了展望。 这是《中国图像图形学报》发布的一篇关于2019年深度学习目标跟踪算法的综述文章,为PDF格式,全文共28页。对近几年深度学习目标跟踪算法感兴趣的读者可以下载阅读。
  • PythonMediapipeUnity姿
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    本项目探索了如何结合Python、Mediapipe与Unity引擎,实现高效的人体姿态实时追踪技术,为虚拟现实及游戏开发提供精准的动作捕捉解决方案。 【作品名称】:基于Python+mediapipe在Unity中实现姿态追踪 【适用人群】:适用于希望学习不同技术领域的小白或进阶学习者。可作为毕设项目、课程设计、大作业、工程实训或初期项目立项。 【项目介绍】 本项目旨在利用mediapipe库实现在Unity中的姿态追踪功能,为用户提供一个结合Python和Unity的开发环境,以实现高效且灵活的姿态识别应用。 ### 第三方库要求 - mediapipe ### 使用方法 1. 首先运行udptracker.py脚本。 2. 根据需要更改ip地址和端口。
  • 识别视频
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    本研究探讨了利用深度学习技术进行视频中行为识别的方法与进展,旨在提高行为分类和理解的准确性与效率。 分享关于深度学习视频中的行为识别的内容,使用Python语言编写,真实可靠且实用。
  • DeepOF:利DeepLabCut姿与表示识别数据分析工具包
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    简介:DeepOF是一款基于DeepLabCut开发的行为识别数据分析工具包,它通过姿势估计和表示学习技术来提高动物或人类行为识别的准确性。 DeepOF是一个用于从自由移动动物的视频时间序列数据进行后处理的工具包。您可以使用此包来提取预定义的主题(例如时间段、攀爬行为以及基本社交互动)或将数据嵌入到感知序列的潜在空间中,以在无监督的情况下发现有意义的主题模式!这两种方法都可以在DeepOF包内实现,并且可以自动比较用户定义的不同实验组。 开始之前,请按照以下步骤进行安装和准备: 1. 打开终端(确保已安装Python 3.6以上版本)。 2. 输入命令:`pip install deepof` 接着,为您的项目创建一个文件夹,在该文件夹内至少包含两个子目录:“视频” 和 “表”。将您正在使用的原始数据或带有标签的视频存放在“视频” 文件夹中;而从DeepLabCut获得的所有跟踪表格(格式可以是.h5 或 .csv)则应放置在“表” 文件夹里。如果您不想自己使用DLC,也无需担心,因为一个兼容的小鼠预训练模型即将发布! 项目结构示例如下: ``` my_project |-- Videos | |-- video1.mp4 # 示例视频文件 |-- Tables |-- tracking_data.h5 # 示例跟踪数据表格 ```