
DLCutils:支持Deeplabcut的DLT算法Matlab代码及更多实用脚本!
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简介:
DLCutils是一款专为深度学习工具箱Deeplabcut设计的辅助软件包,提供了一系列用于数据分析、图像处理以及实验管理的实用Matlab脚本和函数。
DLT算法的Matlab代码DeepLabCut-Utils存储库包含各种脚本以及与其他相关软件包链接的内容。欢迎贡献自己的分析方法,并附上简短的笔记本以介绍使用方式。
用于扩展分析和培训的示例脚本:
1. `scale_training_and_evaluation.py`:此脚本展示了如何为多个项目自动训练、测试及进行视频分析。
2. `scale_analysis_over_subfolders.py`:该脚本说明了如何自动分析组织在子文件夹中的视频。
贡献者使用DLC输出,加载并提供简单的ROI(感兴趣区域)分析示例。这些示例如何计算身体部位在特定ROI上花费的时间,并以帧为单位进行统计。演示Jupyter Notebook展示了如何加载DeepLabCut的输出数据并执行相关分析及绘图功能。
另外还有基于GUI的工具供贡献者使用,该工具用于定义感兴趣区域中身体部分所花时间的行为分析。此外,还提供了集群工具(利用DLC的输出),旨在从动物运动中的深层变异嵌入来识别行为结构。
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