MSD 窗口化 - 在不同扩散模式下估算时间：通过窗口化均方位移分析执行轨迹，评估扩散系数，并确定相应的时间值 - MATLAB 实现

简介：
简介：本工作介绍了MSD窗口化方法，利用MATLAB实现对轨迹数据的处理，评估不同扩散模式下的扩散系数和对应时间值，提供深入理解复杂系统动态特性的工具。 此程序用于分析执行轨迹的窗口均方位移，并估计扩散系数以计算物体处于扩散状态的时间量。该程序读取从斐济插件 TrackMate 输出的 excel 文件。然后在用户给定的窗口上对每个轨迹进行加窗均方位移处理。其目标是分析远离平衡系统的轨迹，例如细胞骨架中的运动蛋白。因此，它认为从 MSD 与时间滞后图的斜率近似得出的负扩散系数具有生物学相关性。 使用用户定义的采样率在每个轨迹内计算对象表现出受限运动、布朗运动、超扩散或施加力模型运动或负扩散（聚合）的时间量。TrackMate Excel 文件应位于与程序相同的路径中名为“track_data”的文件夹中。 主要调用 read_in_data、organize_tracks、windowed_MSD_Analysis 和 Diffusion_coeff_calculator 函数，以读取轨迹数据，将它们组织成轨迹，并执行 wMSD 以及近似扩散系数。