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基于Keras的U-Net眼底图像血管分割代码(Kaggle竞赛修改版)

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简介:
本项目提供了一个使用Keras实现的U-Net模型,专门用于眼底图像中血管的自动分割。此版本是在Kaggle竞赛的基础上进行了优化和改进,旨在提高算法在医学影像分析中的准确性和效率。代码开源,便于研究与应用。 经过修改后,输入图像可以是任何大小的jpg格式文件。如果不是指定尺寸需要进行调整,则使用基于Keras(安装简单)的方法来resize文件。将图像放入指定文件夹中并运行程序即可,在test目录下会输出血管结果图像,并且该方法仅用于测试目的。此工具在大多数眼底图像数据库分割任务上都表现良好,如有问题欢迎提问。

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客服
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  • KerasU-NetKaggle
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    本项目提供了一个使用Keras实现的U-Net模型,专门用于眼底图像中血管的自动分割。此版本是在Kaggle竞赛的基础上进行了优化和改进,旨在提高算法在医学影像分析中的准确性和效率。代码开源,便于研究与应用。 经过修改后,输入图像可以是任何大小的jpg格式文件。如果不是指定尺寸需要进行调整,则使用基于Keras(安装简单)的方法来resize文件。将图像放入指定文件夹中并运行程序即可,在test目录下会输出血管结果图像,并且该方法仅用于测试目的。此工具在大多数眼底图像数据库分割任务上都表现良好,如有问题欢迎提问。
  • U-Net视网膜方法
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    本研究提出了一种改进型U-Net算法,专门针对眼底图像中的视网膜血管进行精确分割,以提高眼科疾病的早期诊断和分析能力。 针对视网膜血管图像特征复杂度高的问题以及现有算法在微血管分割精度低及病理信息误分割等方面的不足,本段落提出了一种融合DenseNet和U-Net网络的血管分割模型。首先通过限制对比度直方图均衡化和滤波器处理增强图像中的血管;其次利用局部自适应gamma校正提升图像亮度并减少伪影干扰;接着采用多尺度形态学滤波来加强微小血管特征信息;最后使用U型密集链接模块进行精确分割。该算法在DRIVE数据集上的实验结果显示,其平均准确率、灵敏度和特异性分别达到了96.74%、81.50%和98.20%,表明了良好的性能表现。
  • .rar__
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    本项目为一个关于眼底图像中血管自动识别与分割的研究资料集,包括各类算法、实验数据及结果分析。适用于医学影像处理和眼科疾病辅助诊断研究。 视网膜眼底血管分割程序已用Matlab实现,并且效果良好,大家可以参考学习。
  • Matlab去噪-VesselExtract:使用U-net CNN进行并去除
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    VesselExtract是一款基于Matlab开发的工具箱,采用U-net卷积神经网络技术高效地从眼底图像中精确提取和去除血管,实现高质量去噪。 在MATLAB环境中开发了一种基于CNN的系统来去除图像中的噪声并提取船只形状特征,用于对血管进行分割,并从眼底图像中移除血管部分。通过使用清理过的眼底版本,在其上方训练分类器以及经过训练的分析工具,以识别与血管形状相关的临床特征,从而提供更精确的诊断模型。 该系统使用的数据集包括DRIVE和STARE两个数据库。对于STARE数据集,采用了Valentina Kouznetsova注释的目标血管图作为参考,因为其提供了更为详尽的信息。为了生成用于训练的大规模图像块(256X256像素),编写了专门的数据预处理脚本以及数据集生成笔记本。 这些补丁是随机创建的,并且为增强模型的鲁棒性,在训练过程中还会考虑图像翻转和添加噪声的情况。为了能够顺利使用该系统,建议按照以下目录结构来组织DRIVE和STARE数据库: ``` VesselExtract/ ├── DRIVE │ ├── test │ └── training ├── STARE │ ├── labels-vk │ └── stare-images └── generate_patches.ipynb # 数据预处理及数据集生成脚本所在位置。 ```
  • U-Net视网膜算法
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    本研究提出了一种改进的U-Net架构,专门用于视网膜血管图像的精确分割。通过优化卷积神经网络结构和引入注意力机制,显著提升了血管边缘检测的准确性和稳定性,为眼科疾病的早期诊断提供了有力工具。 为了应对视网膜图像血管细小导致的分割精度低等问题,本段落在U-Net网络基础上引入了Inception、空洞卷积与注意力机制模块,提出了一种改进的视网膜血管图像分割算法。具体而言,首先,在编码阶段加入了Inception模块,并利用不同尺度的卷积核进行特征提取,以获得多尺度的信息;其次,在U-Net底部增加了级联空洞卷积模块,从而在不增加网络参数的情况下扩大了感受野;最后,在解码阶段结合注意力机制和跳跃连接方式设计反卷积操作,聚焦目标特征,解决了权重分散等问题。实验结果显示,基于DRIVE标准图像集的测试表明,该算法相较于U-Net和其他传统分割方法分别提高了1.15%、6.15%与0.67%的平均准确率、灵敏度和特异性。
  • Retina-Unet:用方法
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    Retina-Unet是一种专门针对眼底图像中血管进行精确分割的设计模型,采用U型网络结构以有效提取和表达复杂的血管特征。 Retina-Unet来源:此代码已经针对Python3进行了优化。数据集可以从百度网盘下载,密码为4l7v。有关代码内容的讲解,请参见相关博客文章《基于UNet的眼底图像血管分割实例》。【注意】run_training.py与run_testing.py的实际作用是让程序在后台运行;如果在运行过程中遇到错误,可以尝试运行src目录下的训练和预测文件以解决问题。
  • 视网膜三维重建
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    本研究致力于开发先进的算法和技术,用于精确分割视网膜血管图像,并构建眼底血管的三维模型,以提高眼科疾病的诊断和治疗水平。 眼底视网膜图像中的血管分布情况为高血压、糖尿病等疾病的早期诊断提供了重要的参考依据。通过计算机处理这些眼底图像可以减轻医生的重复劳动负担。本段落提出了一种新的用于分割眼底视网膜血管图像的算法,该算法首先利用局部归一化方法来消除背景差异性的影响;然后使用期望最大化算法进行聚类操作以实现精确地分割出血管区域;最后基于眼底成像原理通过投影逆变换构建了三维模型,使得可以从多个角度观察和分析视网膜结构。所建立的这种模型有助于更全面深入地理解与研究相关疾病的情况。
  • 视网膜算法:析——利用MATLAB实现高精度
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    本研究提出了一种基于MATLAB的改进视网膜血管分割算法,通过优化技术提升了眼底图像中血管结构的识别精确度和效率。 此脚本的版权归 Tyler L. Coye (2015) 所有。Tyler 是天普大学的一名医学博士生。自发布以来,该方法已被下载超过 6,000 次。对于那些问我是否之前发布过这个算法的人,答案是没有因为医学院的时间限制而未能提前分享。然而,大量使用这种方法的论文证明了它在研究中的价值。 如果有人愿意投入时间与我合作编写此算法,我很乐意共同完成这项工作。该脚本是经过许多小时的工作和解决问题后开发出来的成果。如果您在我的工作中使用此算法,请引用以下信息: 科耶,泰勒(2015 年)。一种用于眼底图像的新型视网膜血管分割算法,MATLAB中央文件交换。 这个脚本在眼底图像中实现视网膜血管的分割,这是一个极具挑战性的任务。
  • 实验报告.docx
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    本报告详细探讨了眼底影像中血管自动分割的方法与技术,通过多种算法对比分析,旨在提高眼科疾病的早期诊断准确率。 使用U-Net和LadderNet网络框架实现眼底图像血管分割,包括训练、测试和评估等环节。
  • 视网膜DenseNet处理方法
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    本研究提出了一种基于DenseNet架构的眼底镜图像处理技术,专注于视网膜血管的有效分割,旨在提高眼科疾病的早期诊断和治疗效果。 视网膜血管分割 作者:zhiyu-Lin 日期:2018-7-1 描述: 本段落探讨了如何利用深度卷积神经网络对眼底图像中的视网膜血管进行有效分割,这是一项数字图像处理的课程作业。 随着近年来医学设备和科技的进步,越来越多的医学影像被应用于病理诊断及研究中。其中,视网膜图像是非常关键的一类医学图像,在预测与诊断眼球疾病方面具有重要的指导意义。 本报告介绍了如何使用深度卷积神经网络对眼底图像进行视网膜血管分割的具体方法:训练二分类和多分类的分割模型(分别用于粗细血管的区分),利用二分类结果来增强原图,进而采用多分类模型进行二次精细分割。 实验结果显示,在大多数情况下,通过两次迭代处理得到的结果比单次处理具有更高的准确性。测试集中F1值达到了0.8253。 环境: - Python >= 3.5 - PyTorch == 0.3.0.post4 - TorchVision