
SpliceAI:一种利用深度学习识别剪接变异的工具
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简介:
SpliceAI是一款先进的计算工具,采用深度学习技术精准预测基因组中的剪接变异,助力遗传学和生物信息学研究。
SpliceAI 是一种基于深度学习的工具,用于识别剪接变体,并预测遗传变异对剪接的影响。更新后的版本包含基因内所有可能替换、单碱基插入以及1-4个碱基缺失的数据注释,这些数据对于学术和非营利组织是免费提供的;其他用途则需获得Illumina, Inc.的商业许可。
安装SpliceAI最简单的方式可以通过pip或conda:
```
pip install spliceai
# 或者
conda install -c bioconda spliceai
```
或者可以从GitHub克隆代码并手动安装:
```bash
git clone https://github.com/Illumina/SpliceAI.git
cd SpliceAI
python setup.py install
```
使用该工具需要tensorflow版本大于等于1.2.0,建议单独通过pip或conda进行安装。
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