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pna=PyTorch; DGL与PyTorch Geometric中的图神经网络主要邻域聚合实现。

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简介:
核心的邻域聚合机制在PyTorch框架中实现了图神经网络的关键组成部分。该资源库提供了一系列基于PyTorch开发的图神经网络模型包括聚合器、归一化层以及PNA架构。通过这些实现,我们构建了一个灵活的图神经网络框架,并对GCN、GAT、GIN和MPNN等主流算法进行了对比研究。 在模型部分,pytorch包含在PyTorch框架中实现的各种GNN模型:聚合器、归一化层以及PNA架构(pna)的实现。这些组件可以与任何类型的图卷积操作相结合,从而构建出一种高度可扩展的图神经网络框架。此外,我们还实现了GCN、GAT、GIN和MPNN等主流图神经网络算法作为对比基准。 在dgl部分,通过实现的PNA模型:聚合器、归一化层以及图层。这些设计基于所实现的PNA架构开发出了包括聚合器、归一化层以及图层在内的组件。pytorch_geometric则基于所实现的PNA架构开发出了包括聚合器、归一化层以及图层在内的组件。

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  • EGNN-PyTorch:基于PyTorchE(n)等价
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    简介:EGNN-PyTorch是一款采用PyTorch框架开发的库,专门用于实现具有平移和旋转不变性的E(n)等价图神经网络,适用于物理系统、分子动力学及材料科学等领域。 EGNN-Pytorch(WIP)中的实现最终可用于Alphafold2的复制。安装方法为:`pip install egnn-pytorch` 用法示例: ```python import torch from egnn_pytorch import EGNN layer1 = EGNN(dim=512) layer2 = EGNN(dim=512) feats = torch.randn(1, 16, 512) coors = torch.randn(1, 16, 3) feats, coors = layer1(feats, coors) feats, coors = layer2(feats, coors) ``` 带边的用法: ```python import torch from egnn_pytorch import EGNN layer1 = EGNN(dim=512) layer2 = EGNN(dim=512) feats = torch.randn(1, 16, 512) coors = torch.randn(1, 16, 3) feats, coors = layer1(feats, coors) ```
  • CapsGNN: PyTorch“胶囊(ICLR 2019)
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    CapsGNN是基于PyTorch框架实现的一种新型模型,结合了胶囊网络和图神经网络的优势,适用于处理图结构数据,已在ICLR 2019会议上展示。 CapsGNN 是一种基于胶囊图神经网络的PyTorch实现(ICLR 2019)。从图神经网络(GNN)学习到的高质量节点嵌入技术已被广泛应用在基于节点的应用程序中,并且一些应用已经达到了最先进的性能水平。然而,当使用从GNN学习得到的节点嵌入来生成图形嵌入时,简单的标量表示可能不足以有效保留节点或整个图的重要属性,导致次优的结果。 受到胶囊神经网络(CapsNet)的启发,我们提出了胶囊图神经网络(CapsGNN),利用了胶囊的概念以解决现有基于GNN的方法中的不足。通过采用胶囊形式来提取节点特征,并使用路由机制在图形级别上捕获重要信息,我们的模型能够为每个图生成多个嵌入。
  • PyTorch卷积简单代码
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    本篇文章通过简洁明了的代码示例,介绍了如何在PyTorch框架下搭建和运行一个基础的卷积神经网络模型。适合初学者快速上手实践。 二维互相关运算 ```python import torch import torch.nn as nn def corr2d(X, K): H, W = X.shape h, w = K.shape Y = torch.zeros(H - h + 1, W - w + 1) for i in range(Y.shape[0]): for j in range(Y.shape[1]): Y[i, j] = (X[i: i + h, j: j + w] * K).sum() return Y ``` 构造上图中的输入数组`X`、核数组`K`来验证二维互相关运算。
  • 基于PyTorchCNN卷积
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    本项目采用Python深度学习框架PyTorch,构建并训练了卷积神经网络(CNN),以解决图像分类问题,展示了CNN在图像识别任务中的高效性。 本段落介绍了如何使用PyTorch实现卷积神经网络(CNN),供读者参考。 我对卷积神经网络有一些认识:它是目前最流行的深度学习模型之一,由于具有局部感受野等特性,使其与人眼识别图像的方式相似,因此被广泛应用于图像识别中。我的研究领域是机械故障诊断,通常使用旋转机械设备的振动信号作为数据源。对于一维信号处理,一般有两种方法:一是直接对其进行一维卷积操作;二是将其映射到时频图上,从而转化为图像识别问题。此前我一直在用Keras搭建网络模型,最近学习了如何利用PyTorch构建CNN,并尝试编写相应的代码。实验中使用的是经典的MNIST手写数字数据集作为训练样本。
  • PyTorch: 曲线拟示例
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    本篇教程深入介绍了如何使用PyTorch进行神经网络曲线拟合,通过构建简单的数据集和神经网络模型,展示了PyTorch在处理回归问题中的强大功能。 今天给大家分享一篇关于使用PyTorch进行神经网络拟合曲线的实例文章,具有很好的参考价值,希望能对大家有所帮助。一起跟随我深入了解吧。
  • CorrectAndSmooth-dgl: DGL“标签传播简模型超越”方法(ICLR 2021)
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    CorrectAndSmooth-dgl是基于深度图库(DGL)实现的一种创新算法,该算法采用标签传播和简化模型,在不使用复杂图神经网络的情况下超越了现有性能标准,成果发表于ICLR 2021。 DGL CorrectAndSmooth的实现基于论文中的GNN模型。该代码库在Python 3.7环境中运行,并且需要以下软件包版本:dgl 0.6.0.post1、torch 1.7.0 和 ogb 1.3.0。 本示例使用的图形数据集为开放图基准(OGB)。以下是所用数据集的摘要: - **ogbn-arxiv** 数据集包含节点数:169,343,边的数量:1,166,243,每个节点有128个特征。评价指标是准确性。 - **ogbn-products** 数据集包含节点数量:2,449,029,边的数量:61,859,140,每个节点的特征数为100。评价指标同样是准确性。 使用方法: 训练基本预测模型,并在不同数据集中应用正确的平滑算法(Correct & Smooth),遵循原始超参数设置。 - 对于**ogbn-arxiv** 数据集:`python main.py` - 使用MLP + C&S的示例命令为:`python main.py --pretrain MLP` - 使用线性模型+ C&S 的示例命令为: `python main.py --pretrain 线性` 注意,这里的C&S代表Correct & Smooth算法。
  • 利用 PyTorch sin 函数方法
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    本篇文章介绍了使用PyTorch框架构建和训练一个简单的神经网络模型来近似模拟正弦函数的过程,详细展示了数据准备、模型搭建及训练步骤。 本教程将介绍如何使用PyTorch创建神经网络来拟合正弦函数。PyTorch是一个流行的深度学习框架,它提供了灵活的张量计算和动态计算图功能,非常适合构建和训练神经网络。 我们将探讨深度神经网络的工作原理:通过多层非线性变换对输入数据建模以找到复杂的数据分布关系。目标是使用神经网络来学习正弦函数的形状,并直观地展示其处理非线性关系的能力。 实现步骤如下: 1. **生成数据集**:我们利用`numpy`库创建从-2π到2π之间等距间隔的400个点,计算每个点对应的正弦值。然后将这些数值转换成PyTorch张量用于后续操作。 2. **定义神经网络模型**:通过继承自`nn.Module`来设计和构建一个简单的全连接层结构(包含ReLU激活函数)。 3. **实例化模型**:创建并初始化我们刚才定义的网络类。 4. **选择损失函数**:对于回归任务,通常采用均方误差作为衡量标准。在PyTorch中,这可以通过`nn.MSELoss()`实现。 5. **设定优化器**:选取一个合适的算法来更新权重参数——这里使用的是Adam优化器,它是一种自适应学习率的方法,并且易于配置和应用。 6. **训练模型**:通过多次迭代数据集(即epoch),计算损失值并利用反向传播技术调整网络中的权重。每隔100次迭代输出当前的误差水平以跟踪进度。 完成训练后,我们可以用此模型对新输入进行预测,并将结果与实际正弦函数曲线作图比较,以此来评估模型性能。 本例演示了如何使用PyTorch搭建一个基本神经网络并用于学习非线性模式。通过修改隐藏层的数量或节点数以及调整训练参数(如学习率),可以进一步优化该模型以更好地匹配数据集。此外,这种基础架构还可以扩展到更复杂的任务中去,例如图像分类和自然语言处理等领域,只需根据具体需求进行相应的数据预处理及网络结构调整即可。
  • PyTorch代码.zip
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    本资源包包含了使用Python和PyTorch库编写的多种神经网络模型代码,适合深度学习初学者及研究者参考实践。 使用PyTorch实现神经网络涉及几个关键步骤:首先需要定义模型架构,这通常包括选择激活函数、确定层的类型(如卷积或全连接)以及指定输入输出尺寸等;其次,要设置损失函数和优化器来训练模型;最后,在数据集上进行前向传播、计算损失并反向传播更新权重。此外,还需要考虑如何处理批量大小、学习率调整等问题以提高训练效率和准确性。
  • 使用PyTorch分类方法
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    本项目利用PyTorch框架构建并训练神经网络模型,旨在高效地进行数据分类任务。通过实验不同架构和优化策略,探索提高分类准确性的有效途径。 今天为大家分享一篇关于使用Pytorch实现神经网络分类方法的文章,希望能为读者提供有价值的参考。让我们一起来看看吧。