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PIV技术,由PIV:Stramer实验室开发,是粒子图像测速(PIV)的MATLAB图片叠加代码。

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简介:
该粒子图像测速(PIV)软件包,其代码位于matlab图片叠加中,由Stramer实验室(位于英国伦敦国王学院)开发。该软件包包含详细的文档,请查阅相关信息。已在MATLAB v2018B版本上进行测试,并需要安装“曲线拟合工具箱”才能正常运行。请注意,此PIV代码不具备图形用户界面(GUI),因此需要在MATLAB环境中作为脚本文件(.m文件)进行执行,通过打开文件并点击“运行”按钮来启动。以下是使用方法。为了获得更全面的参考,请参阅相应的文档。首先,对生物样品的分段堆栈进行必要的图像预处理步骤:在ImageJ中分离出各个通道(例如,绿色通道对应肌动蛋白、品红色通道对应原子核),并将包含要进行PIV测量的实体(例如,绿色通道对应肌动蛋白)的通道保存为[cb#_m.tif]格式,其中cb代表单元体、#是一个递增的整数、m代表移动的实体(例如,洋红色通道对应核),将其保存为[n#_m.tif]格式。如果处理的是细胞,则需要将细胞体(例如,绿色通道对应肌动蛋白)单独分离出来并保存为[no_cb#_m.tif]格式(无细胞体)。此操作对于后续使用的[eroded_heatmap.m]脚本至关重要(如文档所述)。最后,将[cb#_m.tif]、[n#_m.tif]和[no_cb#_m.tif]这三个图像文件一同用于进一步分析。

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  • Matlab中用于PIV—Stramer版本
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    简介:本资源提供由Stramer实验室开发的MATLAB代码,用于粒子图像测速(PIV)中的图片叠加处理。该工具旨在支持流体动力学研究者进行高效的数据分析与可视化工作。 在Stramer实验室(英国伦敦国王学院)开发的粒子图像测速(PIV)软件包使用MATLAB编写,并已在MATLAB v2018B上进行了测试。该代码需要“曲线拟合工具箱”,并且没有图形用户界面,因此应该作为脚本直接在MATLAB环境中运行。 对于要分析的生物样品分段堆栈,需进行以下预处理步骤: - 使用ImageJ打开图像堆叠并分离通道(例如绿色表示肌动蛋白,品红色表示细胞核)。 - 保存包含用于PIV测量实体的通道为[cb#_m.tif]格式。其中“cb”代表单元体,“#”是一个递增整数,“m”则表明该文件中的对象是移动的。 - 同样地,将需要跟踪实体(例如品红色细胞核)的图像另存为[n#_m.tif]。 - 如果研究中使用的是细胞,请从肌动蛋白通道中分离出细胞体,并将其保存为[no_cb#_m.tif]格式。这是为了适应后续使用的脚本。 这些处理步骤对于接下来进行PIV分析以及应用特定脚本(如eroded_heatmap.m)是必要的。
  • 基于MATLAB(PIV)源
    优质
    本源代码为利用MATLAB开发的粒子图像测速(PIV)工具,适用于流体力学研究中的速度场测量与分析。 很好的粒子图像测速(PIV)Matlab源代码,在MATLAB 2010版本下测试通过。
  • MATLAB中部分无法运行 - PIV: Python和MATLAB(PIV)
    优质
    本文探讨了在使用MATLAB进行粒子图像测速(PIV)分析时遇到的部分代码执行问题,并介绍了Python与MATLAB两种编程语言在PIV应用上的代码实现情况。 在MATLAB中有一些粒子图像测速(PIV)代码运行存在问题,在Python和Matlab中的PIV代码中,Python版本的代码(Python_Code.py)经常更新,而Matlab版本相对较旧。如果可以的话,请使用Python代码。在某些情况下,Numba库可以使代码运行得更快(最多2.2倍)。如果您不想使用Numba,请将第12和第15行注释掉。
  • 用于PIV软件
    优质
    本软件专为PIV(粒子图像 velocimetry)技术设计,提供高效的数据处理与分析功能,适用于流体动力学研究中的速度场测量和颗粒追踪。 使用分析两张图片的方法来获取速度场和涡量场的参数非常实用。通过FFT算法可以分析粒子群的位移,并且可以通过获得的速度场利用控制容积法或泊松方程法进行进一步研究。
  • 带GUI仪(PIV)工具-MATLAB(PIVlab)
    优质
    简介:PIVlab是一款基于MATLAB开发的图形用户界面(GUI)工具,专门用于粒子图像测速(PIV)分析。它提供了便捷的数据处理和可视化功能,便于研究人员进行流体动力学研究。 PIVlab是一个基于图形用户界面(GUI)的粒子图像测速软件。它不仅可以计算粒子图像对内的速度分布,还可以用于导出、显示和分析流型的各种参数。用户友好的图形用户界面能够控制PIV相机和激光器,使数据采集与后处理过程更加高效便捷。
  • 基于PIV处理方法
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    本研究探讨了利用粒子图像 velocimetry (PIV) 技术进行流体动力学分析的方法,重点介绍了先进的粒子图像处理技巧及其应用。 关于PIV的文献非常值得一读,对处理PIV图像有很大帮助。
  • 基于QTPIV)程序编写
    优质
    本项目基于QT框架开发了一套用于粒子图像测速(PIV)分析的软件程序,旨在提供高效、准确的数据处理与可视化工具。 用QT编写的PIV(粒子图像测速)程序,在Ubuntu 9.10系统下测试通过。
  • 基于MATLAB velocimetry (PIV) 工具箱
    优质
    本工具箱为使用MATLAB进行粒子图像测速(PIV)分析而设计,提供了一系列功能强大的算法与模块,旨在简化数据处理流程,并支持科研人员和工程师深入探究流体动力学特性。 简单易用的基于MATLAB的粒子图像测速(PIV)工具箱。
  • MATLAB精度-PIV-LiteFlowNet版:利用深度神经网络(LiteFlowNet)方法
    优质
    本项目提供基于MATLAB环境下的PIV(粒子图像测速)精度验证代码,创新性地融入了轻量级深度神经网络LiteFlowNet,旨在提升流场分析中的速度和准确性。适用于科研与工程应用中对流动现象的深入探究。 PIV-LiteFlowNet-en是一种用于执行粒子图像测速(PIV)的深层神经网络技术,旨在估计流体运动并进行可视化分析。该存储库包含两个主要目录: 1. caffe:此文件夹包含了经过训练的模型。 2. demos:这个文件夹内有MATLAB脚本,可用于测试已训练好的模型。 请注意,本项目仅供研究使用,并受到版权保护。任何商业用途需事先获得许可。 如果您在学术研究中应用了这些代码,请引用以下论文: CaiS, LiangJ, GaoQ, XuC, WeiR. Particle image velocimetry based on a deep learning motion estimator, IEEE Transactions on Instrumentation and Measurement (accepted). 或者 CaiS, ZhouS, XuC, GaoQ. Dense motion estimation of particle images via convolutional neural networks. 以上文献详细描述了PIV-LiteFlowNet-en的工作原理和应用。
  • PTVResearch: 跟踪与顶级 - MATLAB
    优质
    PTVResearch是一款专为MATLAB设计的专业工具包,专注于粒子跟踪(PTV)和粒子图像测速(PIV),适用于流体力学及颗粒动力学研究。 PTVResearch 是一款先进的粒子跟踪测速软件,它基于光流方程的 Lucas-Kanade 解法。该软件利用表面特征来确定固体与流体流动的速度场,并适用于多种应用领域,如河流流动、密集颗粒流动以及高保真度流体力学模拟等。除了提供高分辨率的欧拉和拉格朗日速度数据外,PTVResearch 还集成了先进的预处理及后处理工具。其基于 MATLAB 的图形用户界面作为工具箱直接安装使用,无需具备专业知识即可操作。