QuIBL：利用分支长度衡量基因渗入

简介：
QuIBL是一款用于量化和评估基因组中基因渗入程度的软件工具。通过分析分支长度，它能有效识别并计算不同物种或种群间遗传物质交换的情况。 魁北克的Miriam Miyagi 和 Nate Edelman 通过分支长度量化基因渗入QuIBL是一个用于检测并表征物种网络中的渗入事件的程序。它以一组基因树为输入，估计三倍体中被渗入的比例以及这些事件发生的时间。 安装方面, QuIBL目前作为Python脚本分发。为了运行该软件，请确保使用的是 Python v2.7，并且已经正确安装了以下依赖项：joblib、ete3、itertools、sys、numpy、math 以及 ConfigParser，csv，joblib和multiprocessing 。如果您希望用与我们相同的ete3 和 joblib 版本, 可以在主目录的终端中输入 pip install -r quibl_requirements.txt 命令。对于QuIBL的Cython版本的具体说明，请参考相应文件夹中的REA文档。