MATLAB微分方程代码-LGI: Local Gyrification Index 皮质形状的自适应局部回旋指数

简介：
本项目提供了一个基于MATLAB的工具包，用于计算和分析大脑皮层复杂形态的Local Gyrification Index (LGI)，量化个体间脑区结构差异。 在MATLAB环境中使用微分方程代码来描述局部皮质回旋指数通常是在等距测地线或最近邻域环核覆盖的局部皮质区域内测量皮质折叠程度的方法。然而，如果没有仔细设计，则这样的内核可能会轻易覆盖功能上不相关的多个沟和褶皱区域。此外，这可能导致平滑掉皮质折叠细节，使得局部回旋度量变得模糊不清。 本段落提出了一种新的核形状来在特定的沟和褶皱区域内进行局部量化测量皮质回旋情况。我们采用波前传播技术生成空间变化内核形状，并且这种内核形状能够编码皮质折叠模式：相邻的褶顶、沟底以及沟岸等结构信息。为此，通过求解静态汉密尔顿-雅各比偏微分方程实现了沿着褶顶和沟底快速进行各向异性波阵面传播的过程。产生的内核在回旋冠和沟底上自适应地伸展，而在平坦的区域如沟底保持均匀形状。 接着，在建议的空间变化内核中测量局部皮质回旋度量值。使用三角形3D网格作为输入曲面文件（.vtk），中间可以提供或获取沟和褶皱曲线数据格式为.scurve、.gcurve 或 .bary，输出则是外部船体的.vtk 文件以及每个顶点对应的.lgi文本段落件来表示局部回旋度量值。