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基于K-S检验和mRMR的基因选择算法结合方法

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简介:
本研究提出了一种结合Kolmogorov-Smirnov (K-S) 检验与最小冗余最大相关性(mRMR)的新型基因选择算法,有效提升生物信息学中基因筛选的准确性和效率。 为解决基因数据集中的基因选择难题,本段落提出了一种结合K-S检验与最小冗余最大相关(mRMR)原则的基因选择算法。该算法首先利用K-S检验筛选出具有显著区分能力的基因,并进一步通过mRMR准则保留那些与类别高度关联且彼此间相关性较低的基因,形成最终的有效子集。采用支持向量机(SVM)作为分类器,以F1_measure、分类准确率和AUC为评价指标对所选基因子集进行评估。实验结果表明,在五个经典数据集中,本算法不仅运行时间远低于mRMR方法,并且在各项性能指标上均优于RELIEF和FAST等传统算法。因此,结合K-S检验与mRMR的基因选择策略能够有效地识别出高质量的基因子集。

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  • K-SmRMR
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    本研究提出了一种结合Kolmogorov-Smirnov (K-S) 检验与最小冗余最大相关性(mRMR)的新型基因选择算法,有效提升生物信息学中基因筛选的准确性和效率。 为解决基因数据集中的基因选择难题,本段落提出了一种结合K-S检验与最小冗余最大相关(mRMR)原则的基因选择算法。该算法首先利用K-S检验筛选出具有显著区分能力的基因,并进一步通过mRMR准则保留那些与类别高度关联且彼此间相关性较低的基因,形成最终的有效子集。采用支持向量机(SVM)作为分类器,以F1_measure、分类准确率和AUC为评价指标对所选基因子集进行评估。实验结果表明,在五个经典数据集中,本算法不仅运行时间远低于mRMR方法,并且在各项性能指标上均优于RELIEF和FAST等传统算法。因此,结合K-S检验与mRMR的基因选择策略能够有效地识别出高质量的基因子集。
  • mRMR特征
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    mRMR(Minimum Redundancy Maximum Relevance)是一种高效的特征选择算法,旨在从大量候选特征中挑选出最能代表类别的最小特征子集。通过最大化目标属性与所选特征间的相关性同时最小化这些特征之间的冗余度,以提高分类器性能和减少计算复杂性。 这段文字描述的代码实现了最小冗余最大相关性(mRMR)算法,并包含了数据和案例,因此很容易运行通过。
  • mRMR特征.rar
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    本资源包含mRMR(最小冗余最大相关性)特征选择算法的相关资料与代码实现,适用于机器学习和数据挖掘中特征选取。 MRMR算法的MATLAB代码用于特征选择。这段代码实现了MRMR算法,并且有详细的注释以确保可以成功运行。如果遇到任何问题,请联系博主寻求帮助。
  • 遗传优化K-means聚类中K
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    本研究提出一种利用遗传算法优化K-means聚类分析中的K值选择问题的方法,旨在提高数据分类准确性。通过模拟自然进化过程搜索最优解,有效克服了传统方法易陷入局部最优点的局限性。 之前找了很多利用遗传算法优化聚类数K值的程序,但发现网上很多程序无法使用。因此只能自己编写一个程序来解决这个问题。该程序基于MATLAB编写,并调用了kmeans函数和遗传算法工具箱。此程序的核心在于定义遗传算法的适应度函数,在最后取整数值作为K值。此外,程序还附带了一个自定义排序函数,用于先对矩阵中的A列进行排序,再根据排序结果对B列进行相应的调整,从而得到一个A、B两列都经过重新排列后的矩阵。
  • SVM、RF与mRMR特征
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    本研究探讨支持向量机(SVM)、随机森林(RF)及最小冗余最大相关性(mRMR)三种特征选择算法的应用与比较,旨在优化机器学习模型性能。 特征选择算法包括SVM(支持向量机)、RF(随机森林)以及mRMR(最小冗余最大相关性)等多种方法。这些算法在不同的应用场景中展现出各自的优势,能够有效地从数据集中挑选出最具有代表性的特征子集,从而提高模型的性能和可解释性。
  • MATLAB中MRMR与RelieF特征
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    本文探讨了在MATLAB环境下实现并比较了MRMR和ReliefF两种特征选择算法的有效性和实用性,为数据挖掘提供优化方案。 【达摩老生出品,必属精品】资源名:matlab MRMR和relieff特征选择方法 资源类型:matlab项目全套源码 源码说明:全部项目源码都是经过测试校正后百分百成功运行的,如果您下载后不能运行可以联系我进行指导或者更换。 适合人群:新手及有一定经验的开发人员
  • MATLAB中K-S代码-局部新颖性测:本地学习
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    本研究在MATLAB环境中提出了一种利用Kolmogorov-Smirnov(K-S)检验进行局部新颖性检测的新方法,通过构建局部学习模型来识别数据集中的异常模式。 MATLAB中的KS检验代码用于本地新奇检测的软件包包含执行局部新颖性检测所需的所有Matlab源代码。该方法基于以下论文:Paul Bodesheim 和 Alexander Freytag 以及 Erik Rodner 和 Joachim Denzler 的“多类识别问题中的局部新颖性检测”。IEEE计算机视觉应用冬季会议(WACV)的论文集,2015年。 如果您使用此代码,请引用该论文。版权由 Paul Bodesheim、Alexander Freytag、Erik Rodner 以及 Joachim Denzler 拥有(LGPL)。 软件包包含以下文件: - learn_local_novelty_detection_model.m - test_local_novelty_detection_model.m - demo_local_novelty_detection.m - README.md - License.txt 此外,还包含了论文中的源代码。
  • SVM变量
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    本研究提出了一种基于支持向量机(SVM)的变量选择方法,旨在提高机器学习模型预测准确性的同时简化模型结构。通过优化算法筛选关键特征,有效避免过拟合现象,为数据挖掘和模式识别提供有力工具。 在面对众多变量的情况下,进行初步筛选是很有必要的,这样可以减轻后续建模计算的负担。本段落介绍了一种新的有效的变量选择方法,这种方法不需要依赖于模型的具体设定,因此具有很高的灵活性与广泛的适用性。
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    本研究提出了一种改进的RELIEF算法,通过优化特征权重计算过程来提升机器学习模型性能,适用于高维数据集中的特征选择。 该程序用于特征选择,详细说明了其工作原理,思路简单易懂,方法较为简便,适合初学者使用。