论文研究：LC/MS代谢组学数据不同标准化方法的对比分析

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简介：
本研究采用液相色谱-质谱（LC/MS）技术进行代谢组学数据分析，并比较了多种标准化方法的效果，旨在优化数据处理流程。在代谢组学数据处理过程中，规范化是一个关键环节，旨在减少非生物因素导致的变异（如仪器批次效应），同时保留生物学上的差异性。多种归一化技术通常针对每个样本进行调整。其中一种常见方法是基于总离子流(TIC)对单一样本中的所有特征强度值进行标准化处理，即将其除以该样品中所有特征强度之和。然而，在代谢组学数据集中，这些方法的许多假设往往并不可靠。因此，我们对比了上述传统技术与两种新的归一化策略：一种是针对每种特定代谢物而非整个样本进行调整（BRDG）；另一种则基于实验样品中的中位数水平对每个代谢物值进行标准化处理（MED）。通过评估大型人血浆数据集内一部分目标测定的代谢物的相关性，我们发现BRDG和MED归一化技术显著优于其他方法，并且后者的性能通常甚至不及完全不执行任何规范化操作。

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论文研究：LC/MS代谢组学数据不同标准化方法的对比分析

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本研究采用液相色谱-质谱（LC/MS）技术进行代谢组学数据分析，并比较了多种标准化方法的效果，旨在优化数据处理流程。在代谢组学数据处理过程中，规范化是一个关键环节，旨在减少非生物因素导致的变异（如仪器批次效应），同时保留生物学上的差异性。多种归一化技术通常针对每个样本进行调整。其中一种常见方法是基于总离子流(TIC)对单一样本中的所有特征强度值进行标准化处理，即将其除以该样品中所有特征强度之和。然而，在代谢组学数据集中，这些方法的许多假设往往并不可靠。因此，我们对比了上述传统技术与两种新的归一化策略：一种是针对每种特定代谢物而非整个样本进行调整（BRDG）；另一种则基于实验样品中的中位数水平对每个代谢物值进行标准化处理（MED）。通过评估大型人血浆数据集内一部分目标测定的代谢物的相关性，我们发现BRDG和MED归一化技术显著优于其他方法，并且后者的性能通常甚至不及完全不执行任何规范化操作。

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