
NMF的MATLAB代码-Blind_Unmixing_NMF_RI:用于高混合多光谱流和图像细胞计数的光谱分解MATLAB代码...
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简介:
这段MATLAB代码实现了基于非负矩阵分解(NMF)的盲解混算法,专门针对高复杂度的多光谱流式数据及图像进行高效的光谱解析与细胞自动计数。
动机:多重免疫染色与多光谱细胞术的最新进展为同时可视化液体及固体样品中的众多生物标记提供了可能。然而,正确地分解荧光线发射是一项具有挑战性的任务,并通常需要通过对照样本中各个荧光染料的表征来进行。
随着用于分析的荧光染料数量增加,实验所需的时间和试剂成本也随之上升。因此,在此我们提出了一种完全无监督的方法来实现盲谱解混,以分离高度混合的数据集中的荧光线发射,并且无需依赖对照样本进行操作。
为达成这一目标,我们在现有的非负矩阵分解方法基础上进行了扩展并引入了几个关键改进:基于理论光谱图的初始化、自动选择“稀疏”数据以及使用多层优化器来重新初始化。我们的算法已通过合成数据进行了详尽测试,并在不同水平上验证其有效性。
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