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NCBI-BLAST-2.10.1+-X64-Win64.tar.gz

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简介:
这是一个包含NCBI BLAST 2.10.1+版本(适用于64位Windows系统)的压缩文件,内含生物信息学中常用的序列比对工具。 NCBI提供了名为BLAST+的一系列命令行工具,允许用户在自己的服务器上执行BLAST搜索,而无需受大小、容量和数据库限制的约束。BLAST+可以通过命令行使用,并可以直接集成到工作中。

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  • NCBI-BLAST-2.10.1+-X64-Win64.tar.gz
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    这是一个包含NCBI BLAST 2.10.1+版本(适用于64位Windows系统)的压缩文件,内含生物信息学中常用的序列比对工具。 NCBI提供了名为BLAST+的一系列命令行工具,允许用户在自己的服务器上执行BLAST搜索,而无需受大小、容量和数据库限制的约束。BLAST+可以通过命令行使用,并可以直接集成到工作中。
  • NCBI-BLAST-2.12.0+-Linux-x64.tar.gz
    优质
    这是一个用于序列比对的生物信息学工具包BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)的压缩文件,版本为2.12.0+,适用于64位Linux系统。 NCBI blast 2.12.0 for Linux版本提供了一系列用于核苷酸序列比对的工具和服务。
  • Pandoc-2.10.1-Win64.zip
    优质
    Pandoc-2.10.1-Win64.zip 是 Pandoc 软件的 Windows 64位版本安装文件,适用于需要在 Windows 系统上进行文档格式转换和处理的用户。 推荐下载pandoc-2.10.1-win64版的一键安装包。由于官网的下载速度较慢,这里提供一个加速下载的资源。
  • Blast-2.2.26-x64-Linux
    优质
    Blast-2.2.26-x64-Linux 是一款针对Linux 64位系统的高效生物信息学工具,主要用于序列比对分析,广泛应用于基因组研究和蛋白质功能预测。 **BLAST:生物学中的序列比对利器** **一、BLAST简介** BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是由美国国立生物技术信息中心开发的一种高效的序列比对工具,用于快速查找数据库中与查询序列具有高度相似性的序列。标题中的blast-2.2.26-x64-linux表明这是BLAST的一个特定版本,该版本专为64位Linux操作系统设计。 **二、BLAST工作原理** BLAST的核心算法基于Smith-Waterman全局比对算法的简化版,通过查找局部最优匹配来实现高效搜索。其主要步骤包括: 1. **种子查找**:在数据库序列中寻找与查询序列相匹配的小片段(种子)。 2. **扩展匹配**:以种子为中心向两侧扩展,寻找最佳局部匹配区域。 3. **打分和剪切**:根据评分系统评估匹配度,并将低于阈值的低质量部分剔除。 4. **报告结果**:输出最高得分的比对结果。 **三、BLAST家族** BLAST家族包括多个成员,每个都有不同的应用场景: 1. **blastn**:用于核苷酸序列之间的比对,常应用于基因组DNA分析。 2. **blastp**:针对蛋白质序列进行比较,适用于氨基酸序列对比。 3. **blastx**:将核苷酸序列翻译成所有六个开放阅读框,并与蛋白质数据库进行比对。 4. **tblastn**:将蛋白质序列与核苷酸数据库进行反向翻译比对。 5. **tblastx**:两个核苷酸序列间的双向翻译对比。 **四、NCBI提供的服务** NCBI提供了在线BLAST服务,用户可以直接在网站上提交序列进行比对。同时提供本地安装版供下载使用,如blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz,方便大规模数据处理需求。 **五、安装与使用** 1. **下载与解压**:从NCBI官网或镜像站点获取适用于64位Linux系统的BLAST软件包(例如blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz),并利用`tar -zxvf blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz`命令进行解压缩。 2. **配置环境**:将解压后的bin目录添加至系统PATH环境变量中,以便在任何位置运行BLAST命令。 3. **执行序列比对**:通过命令行界面输入相应的BLAST指令及参数(例如`blastn -query query.fasta -db db.fasta -out results.txt`),启动序列对比操作。 4. **解析结果**:完成对比后,通常以ASN.1格式存储的结果可以使用ncbi的`blastdbcmd`工具或其他第三方软件转换为更易读的形式如FASTA或HTML。 **六、BLAST在生物信息学中的应用** BLAST广泛应用于基因功能注释、物种进化分析、构建基因家族以及疾病相关突变研究等众多领域。其高效性和便捷性使其成为生物学研究人员不可或缺的工具之一。 **七、总结** blast-2.2.26-x64-linux是适用于64位Linux系统的旧版本BLAST软件包,通过深入了解其工作原理、使用方法及在生物信息学中的应用,可以更加有效地利用这一强大工具进行序列对比分析,并揭示生命科学领域的诸多秘密。同时掌握和运用BLAST对于科研人员以及生物信息学爱好者来说都具有重要的价值。
  • osgearth-2.10.1-vs2019-x64.rar
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    本资源为OSGEarth 2.10.1版本针对Visual Studio 2019编译的64位库文件,适用于开发地理空间信息应用。 基于VS2019和OpenSceneGraph-3.6.4编译的osgearth-2.10.1 x64开发包。该开发包包含lib库、include头文件、data数据资源,以及编译好的dll和exe文件等内容。由于文件尺寸较大,采用了rar格式进行压缩。
  • CMake-3.14.1-Win64-x64
    优质
    CMake-3.14.1-Win64-x64 是Windows 64位系统上安装的版本为3.14.1的跨平台开源自动化构建工具CMake,用于管理软件编译过程。 CMake的最新版本是3.14.1,适用于Windows 64位系统。官网提供下载地址,但下载速度较慢。
  • CMake-3.11.1-Win64-x64
    优质
    CMake-3.11.1-Win64-x64 是Windows 64位系统下用于编译和管理软件项目的版本控制工具,适用于需要跨平台构建环境的开发者。 cmake-3.11.1-win64-x64 用于编译 OpenCV,除此之外它还有哪些用途呢?
  • CMake-3.10.2-Win64-x64
    优质
    CMake-3.10.2-Win64-x64 是 Windows 64位系统上安装的 CMake 版本 3.10.2,用于简化跨平台项目的编译和构建过程。 cmake-3.10.2-win64-x64的最新版本从外网下载速度很慢,因此我将其保存了下来。
  • CMake-3.7.0-Win64-x64
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    CMake-3.7.0-Win64-x64 是一个适用于Windows 64位系统的CMake 3.7.0版本,用于自动化构建过程的跨平台开源解决方案。 cmake-3.7.0-win64-x64 方便没有梯子的朋友。
  • CMake-3.19.0-Win64-x64.zip
    优质
    CMake-3.19.0-Win64-x64.zip 是一个适用于Windows 64位操作系统的压缩文件,内含版本为3.19.0的CMake软件安装包,用于自动化构建过程。 The release includes CPack, and the .sh files are self-extracting gziped tar files. To install a .sh file, run it with /bin/sh and follow the instructions provided. The OS-machine.tar.gz files are gziped tar archives of the installation tree. Similarly, the OS-machine.tar.Z files are also compressed using an older compression format known as compress (which uses .Z extension).