
Morlet小波的MATLAB代码及MouseMotionMapper:半监督鼠标行为分类的MATLAB工具
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简介:
本项目包含基于Morlet小波变换的MATLAB实现代码以及MouseMotionMapper——一种用于分析和分类用户鼠标运动行为的半监督学习工具箱,旨在提供信号处理与行为识别的研究资源。
Morlet小波的MATLAB代码用于分析开放域行为的小鼠自闭症模型中的深层行为特征。
Ugne Klibaite、Mikhail Kislin、Jessica L. Verpeut、Sun Xiaoting Sun、Joshua W. Shaevitz和Samuel S.-H. Wang在bioRxiv 2021年2月16日发表的手稿中提供了该存储库,其中包含上述研究的分析代码。
MouseMotionMapper是一个独特的半监督行为分类及标签流程框架。此框架运用深度神经网络、PCA(主成分分析)、Morlet小波变换、t-SNE和k-Means聚类技术来定义不同的行为类别。通过最新的身体部位跟踪进展,该系统能够捕捉到老鼠的姿势变化。
在此基础上,我们对MouseMotionMapper进行了改进,使其适用于基于身体部位位置的时间序列数据的行为分类。
每个行为类别都有样本片段生成为电影:
- 空闲
- 修整
- 慢速探索
- 快速探索
- 后部活动
- 攀登
- 平缓行走(AMBLE)
- 步行(STEP)
- 转身(TURN)
- 前进(机车)
该存储库包括以下功能和方法:
1. 本地及集群的跟踪与对齐代码;
2. 包含2个和18个身体部位的LEAP模型;
3. 聚类嵌入编码;
4. 训练数据集以及主成分系数;
5. 指纹编码以识别行为模式;
6. 用于将新数据映射到行为空间的代码;
7. 分析图形生成工具。
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