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Autodock-Vina与视频教学.rar

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简介：
本资源包含Autodock-Vina软件使用教程及配套视频讲解，帮助用户快速掌握分子对接技术，适用于药物设计和生物信息学研究。 Autodock-Vina在Autodock的基础上开发，采用了多线程任务模式，提高了运算速度，并提供了一个简单的官网教学视频供用户学习使用。

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  • Autodock-Vina与视频教学.rar
    优质
    本资源包含Autodock-Vina软件使用教程及配套视频讲解，帮助用户快速掌握分子对接技术，适用于药物设计和生物信息学研究。 Autodock-Vina在Autodock的基础上开发，采用了多线程任务模式，提高了运算速度，并提供了一个简单的官网教学视频供用户学习使用。
     
  • Autodock Vina软件
    优质
    AutoDock VINA是一款用于分子对接的强大且灵活的开源软件工具，广泛应用于药物设计和蛋白质工程领域。 Autodock Vina软件非常好用，计算也很方便。
     
  • AutoDock-Vina：AutoDock Vina工具
    优质
    AutoDock-Vina是一款用于分子对接的强大开源软件，它能够预测小分子与生物大分子之间的相互作用方式和结合能力。 AutoDock Vina 是一个快速且广泛应用的开源对接引擎之一。它是一个集成式的计算对接程序，基于简单的评分功能以及高效的梯度优化构象搜索算法设计而成。该软件最初由分子图形实验室的博士 Oleg Trott 设计并实现，并现由斯克里普斯研究所 Forli 实验室维护和开发。 AutoDock Vina 具有以下特点： - 支持 AutoDock 4.2 和 Vina 的评分功能，可以同时对接多个配体； - 提供批处理模式以进行虚拟筛选； - 支持大环分子的对接操作； - 包含水合对接协议，可编写和加载外部 AutoDock 映射文件； - 具备 Python 3 绑定。 AutoDock Vina 根据 Apache 许可证版本 2.0 发行。有关文献资料、安装说明及教程，请参考官方文档或相关资源。
     
  • 批量进行 Autodock Vina 分子对接
    优质
    本项目介绍如何使用Autodock Vina软件进行大规模分子对接计算，旨在优化药物设计流程，提高虚拟筛选效率。 分子对接是生物计算领域中的一个重要技术，用于预测小分子（如药物候选物）如何与大分子（如蛋白质）结合，在药物设计和发现中至关重要。Autodock Vina是一款高效且用户友好的分子对接软件，能够自动寻找最优的配体-受体复合物构象，并评估其结合亲和力。 在Ubuntu 18.04上安装Autodock Vina及相关工具包时，请确保系统是最新的，通过`sudo apt-get update`更新包列表。接着安装必要的依赖项，包括图形库、Python库等。下载并解压Autodock Vina及MGLTools（一套用于处理分子数据的辅助工具）。 创建一个目录存放这些软件，并按照以下步骤进行安装： 1. 安装Open Babel，这是一个多格式化学转换工具。 2. 解压并安装Autodock Vina二进制文件。 3. 使用`python install.py`脚本安装MGLTools。 4. 修改vina.sh脚本设置环境变量以包含Autodock Vina和MGLTools的路径。 5. 预处理受体和配体分子，使用prepare_receptor4.py和prepare_ligand4.py脚本将其转化为Autodock Vina可读格式。 6. 使用配置文件conf.txt控制参数运行vina进行对接任务。 7. 输出结果通常为pdbqt格式，并可以进一步转换成其他格式如sdf以方便后续分析。 Slurm（Simple Linux Utility for Resource Management）是一种广泛使用的集群作业调度系统，特别适合高性能计算环境。安装和配置Slurm时，请先安装必要的库文件，包括munge服务进行安全身份验证。 启动munge服务并确保其正常运行后，再安装slurm-wlm、slurmd及slurmctld组件。 编写定义集群拓扑、资源分配策略等的`slurm.conf`文件，并根据实际硬件配置和需求调整。例如，指定节点名称、数量以及每个节点上的核心数、内存大小与网络设置。 完成这些步骤后启动Slurm服务： 1. 启动slurmctld（控制器）服务。 2. 启动slurmd（节点）服务。 至此，Autodock Vina和Slurm已安装并配置完毕，在Slurm调度系统上可以批量运行分子对接任务以有效利用集群计算资源，并提高研究效率。
     
  • FME教学视频.rar
    优质
    FME教学视频包含了利用FME软件进行空间数据转换、管理和分析的教学教程。视频内容涵盖基础操作到高级功能应用，适合初学者和进阶用户学习参考。 对于初学者来说，观看FME操作的视频有助于更好地理解这一强大的工具软件，并且具有很高的学习价值。
     
  • EFDC教学视频.rar
    优质
    《EFDC教学视频》是一套全面讲解环境流体动力学模型（EFDC）应用与操作的教学资料集，内含多个实用案例解析及详细步骤演示，适合环保、水利等领域的专业人士学习使用。 有二十几个efdc教学视频，喜欢的话可以赶紧下载。
     
  • IGI教学视频1.rar
    优质
    本资源为《IGI教学视频》压缩文件版，内含一系列关于IGI软件或技能的教学影片，适合学习者和专业人士深入理解与掌握相关知识。 请提供关于igi parcam的详细操作视频。
     
  • Silvaco TCAD教学视频教程RAR
    优质
    本资源为Silvaco TCAD教学视频教程压缩包，包含详细的教学视频和相关文档，适合半导体器件建模与模拟的学习者使用。 学习TCAD。
     
  • AutoDock与MGLtools1.5.6-Windows版.rar
    优质
    该压缩文件包含AutoDock和MGL工具集1.5.6的Windows版本安装包。AutoDock用于分子对接研究，MGL工具集提供图形用户界面支持及格式转换功能。 本软件为蛋白对接软件的Windows版本，包含了AutoDock对接软件和Autodocktools对接视图软件。
     
  • CASS3D插件视频教学.rar
    优质
    本资源为《CASS3D插件视频教学》合集，内含一系列详细的教学视频，旨在帮助用户掌握CASS3D插件的各项功能和操作技巧，适用于工程设计人员学习与参考。 房地一体是指房地产作为一个整体进行开发和管理的概念，在这种模式下，土地使用权与地上建筑物的所有权紧密结合在一起。这样可以更好地保障产权人的权益，并促进资源的有效利用和发展。