
MATLAB CNN代码解析 - STNeuroNet:用于双光子钙成像中快速稳健主动神经元分割的时空深度学习方法的软件实现...
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简介:
STNeuroNet是一款基于MATLAB开发的CNN工具,专为双光子钙成像数据设计,提供高效且准确的神经元分割解决方案。该软件通过结合时间与空间信息优化了主动神经元识别过程。
MatlabCNN代码详解:ST神经网络(STNeuroNet)是一个3维卷积神经网络(CNN),用于从钙成像数据中分割“活动”神经元。该网络是通过基于TensorFlow的开源CNN平台NiftyNet实施的,您可以使现有网络适应您的影像数据。
特征包括:
- 预处理和后处理步骤:用于钙成像数据批处理的3DCNN。
- MATLAB GUI:用于手动标记钙成像数据。
系统要求:
- Python 3.5(建议使用Anaconda)
- MATLAB 2017b
- MATLAB Runtime版本9.3
- 神经网络工具箱、图像处理工具箱
其他软件需求包括TensorFlow-gpu 1.4,需要CUDAToolkit 8.0和cuDNN v7.0。此外还需要NiftyNet版本0.2.0.post1。
文献资料提供了操作指南,并建议引用Soltanian-Zadeh等人于2019年发表的文章作为参考。
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