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EGNN-PyTorch:基于PyTorch的E(n)等价图神经网络实现

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简介:
简介:EGNN-PyTorch是一款采用PyTorch框架开发的库,专门用于实现具有平移和旋转不变性的E(n)等价图神经网络,适用于物理系统、分子动力学及材料科学等领域。 EGNN-Pytorch(WIP)中的实现最终可用于Alphafold2的复制。安装方法为:`pip install egnn-pytorch` 用法示例: ```python import torch from egnn_pytorch import EGNN layer1 = EGNN(dim=512) layer2 = EGNN(dim=512) feats = torch.randn(1, 16, 512) coors = torch.randn(1, 16, 3) feats, coors = layer1(feats, coors) feats, coors = layer2(feats, coors) ``` 带边的用法: ```python import torch from egnn_pytorch import EGNN layer1 = EGNN(dim=512) layer2 = EGNN(dim=512) feats = torch.randn(1, 16, 512) coors = torch.randn(1, 16, 3) feats, coors = layer1(feats, coors) ```

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  • EGNN-PyTorchPyTorchE(n)
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    简介:EGNN-PyTorch是一款采用PyTorch框架开发的库,专门用于实现具有平移和旋转不变性的E(n)等价图神经网络,适用于物理系统、分子动力学及材料科学等领域。 EGNN-Pytorch(WIP)中的实现最终可用于Alphafold2的复制。安装方法为:`pip install egnn-pytorch` 用法示例: ```python import torch from egnn_pytorch import EGNN layer1 = EGNN(dim=512) layer2 = EGNN(dim=512) feats = torch.randn(1, 16, 512) coors = torch.randn(1, 16, 3) feats, coors = layer1(feats, coors) feats, coors = layer2(feats, coors) ``` 带边的用法: ```python import torch from egnn_pytorch import EGNN layer1 = EGNN(dim=512) layer2 = EGNN(dim=512) feats = torch.randn(1, 16, 512) coors = torch.randn(1, 16, 3) feats, coors = layer1(feats, coors) ```
  • PyTorchCNN卷积
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    本项目采用Python深度学习框架PyTorch,构建并训练了卷积神经网络(CNN),以解决图像分类问题,展示了CNN在图像识别任务中的高效性。 本段落介绍了如何使用PyTorch实现卷积神经网络(CNN),供读者参考。 我对卷积神经网络有一些认识:它是目前最流行的深度学习模型之一,由于具有局部感受野等特性,使其与人眼识别图像的方式相似,因此被广泛应用于图像识别中。我的研究领域是机械故障诊断,通常使用旋转机械设备的振动信号作为数据源。对于一维信号处理,一般有两种方法:一是直接对其进行一维卷积操作;二是将其映射到时频图上,从而转化为图像识别问题。此前我一直在用Keras搭建网络模型,最近学习了如何利用PyTorch构建CNN,并尝试编写相应的代码。实验中使用的是经典的MNIST手写数字数据集作为训练样本。
  • DBCNN-PyTorch: PyTorch双线性卷积象质量评
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    简介:DBCNN-PyTorch是一个在PyTorch框架下实现的基于双线性卷积神经网络的盲图像质量评估工具,用于高效地进行图像质量分析与测试。 DBCNN-Pytorch 使用深双线性卷积神经网络进行盲图像质量评估的实验性PyTorch实现。 目的: 鉴于PyTorch在学术界的受欢迎程度,我们希望此项目能够帮助IQA研究人员。该存储库将作为集成先进IQA技术的活动代码库。 要求: - PyTorch 0.4+ - Python 3.6 默认设置下的用法: 运行 `python DBCNN.py` 可以使用默认配置进行实验。 如需重新训练SCNN,需要Matlab和原始存储库来生成合成失真的图像。然后可以执行命令 `python SCNN.py`。 引文: @article {zhang2020blind, title = {使用深双线性卷积神经网络进行盲图像质量评估}, 作者= {张维霞,马克德,闫家加邓,德祥和王舟}, 期刊 = {IEEE视频技术电路和系统的交易}, 卷号 = {30}, 期数 = {1}, 页码 = {36--47}, 年份 = {2020} } 致谢:
  • PyTorchTPA-LSTM
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    本研究提出了一种基于PyTorch框架的TPA-LSTM神经网络模型,旨在提升长短期记忆网络在特定任务上的性能。通过引入时间关联与注意力机制,该模型增强了对序列数据中重要信息的捕捉能力。 TPA 会选择相关变量并赋予权重,利用卷积来捕捉可变的信号模式。注意力机制会对 BiLSTM 的隐含层进行加权求和。这些内容出自论文《Temporal Pattern Attention for Multivariate Time Series Forecasting》。
  • NGCF-PyTorchPyTorch协同过滤
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    NGCF-PyTorch是一款利用PyTorch框架开发的高效神经网络图协同过滤推荐系统工具,适用于深度学习在推荐系统中的应用研究。 我对神经图协同过滤的PyTorch实现基于王翔、何湘南、王萌、冯福利和蔡达生(2019)的研究成果。该研究在SIGIR19会议上发表,会议地点是法国巴黎,时间是从2019年7月21日至25日。 我的实现主要是指原始的TensorFlow版本,并且具有与原项目一样的评估指标。以下是使用Gowalla数据集时的一个示例结果: 最佳迭代=[38]@[32904.5] 回忆率=[0.15571 0.21793 0.26385 0.30103 0.33170], 精确度=[0.04763 0.03370 0.02744 0.02359 0.02088], 击中率=[0.53996 0.64559 0.70464 0.74546 0.77406],NDCG=[0.22752 0.26555 0.29044 0.30926 0.32406]。
  • GMAN-PyTorchPyTorch多注意
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    简介:GMAN-PyTorch是一款使用PyTorch框架构建的高效图注意力网络工具包,专门针对大规模图数据设计,提供强大的节点分类、链接预测等机器学习功能。 GMAN的PyTorch实现:用于交通预测的图多注意网络 这是以下论文中的图多注意力网络(Graph Multi-Attention Network, GMAN)的一个测试版PyTorch实现: Chuanpan Zheng、Xiaoliang Fan、Cheng Wang 和 Jianzhong Qi。 GMAN: A Graph Multi-Attention Network for Traffic,AAAI2020。 要求:Python 火炬(torch)、熊猫(pandas)、Matplotlib 数据集可以解压缩并从此存储库中的数据目录加载。 引文: 此版本的实现仅用于学习目的。 有关研究,请参考并引用以下论文: @inproceedings{ GMAN-AAAI2020, author = Chuanpan Zheng and Xiaoliang Fan and Cheng Wang and Jianzhong Qi, title = GMAN: A Graph Multi-Attention Network for Traffic, }
  • PyTorch英文文本分类
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    本项目利用PyTorch框架实现了针对英文文本数据集的深度学习分类模型,旨在探索自然语言处理中的文本分类问题。 本资源包含7篇配套博客辅助讲解,代码架构清晰且易于理解。代码具有很强的拓展性,方便移植并使用自己的数据集及模型。主要采用Pytorch实现。
  • PixelCNN:Pixel递归PyTorch版本
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    本项目为PixelCNN模型的PyTorch实现,借鉴了PixelRNN的设计理念,旨在高效生成高质量图像,适用于图像补全与超分辨率任务。 **像素递归神经网络(PixelCNN):** PixelCNN是一种基于深度学习的图像生成模型,由Alex Graves等人在2016年提出。这个模型利用条件概率递归地预测图像中的每个像素值,即每个像素依赖于它前面的所有像素。这种递归结构使得PixelCNN能够捕捉到图像中的上下文信息,并且可以生成连贯而具有视觉意义的图像。 **PyTorch实现:** 在Python环境中使用强大的深度学习框架PyTorch来训练和应用PixelCNN模型是非常方便的。通过定义网络架构、设置优化器参数以及加载数据,研究人员与开发者可以在PyTorch中轻松地进行一系列操作以完成模型的应用。 **模型架构:** PixelCNN的核心是卷积神经网络(Convolutional Neural Network, CNN)和残差块(Residual Blocks),这些组件能够帮助模型学习复杂的图像特征。在PixelCNN中,每个像素的预测都是通过多个卷积层来实现的,每一层捕捉到不同尺度上的局部信息。同时,为了确保当前像素值依赖于它左侧及上方已知的所有像素值以保持顺序性,使用了条件概率。 **训练过程:** 训练PixelCNN通常包括以下步骤: 1. **数据预处理**:将图像转换为模型可以接受的格式。 2. **构建模型**:定义网络结构,包括卷积层、激活函数(如ReLU)和残差连接等。 3. **损失函数**:常用的是交叉熵损失来度量预测像素值与真实值之间的差异。 4. **优化器选择**:通常选用Adam或SGD这样的优化算法以更新模型参数。 5. **训练循环**:遍历数据集,执行前向传播、计算损失、反向传播和参数更新等操作。 6. **验证与测试**:在独立的数据集中评估生成图像的质量。 **应用场景:** PixelCNN可以用于: 1. **图像生成**:创建逼真的新图像如风景或人物图。 2. **数据增强**:通过生成额外的训练样本提高模型对不同变体的适应能力。 3. **图像修复**:在部分像素丢失的情况下,利用上下文信息预测缺失的部分。 4. **图像编码**:将图像压缩成更短的数据序列以实现高效存储与传输。 实际应用中可能需要根据特定任务调整和优化PixelCNN模型。例如增加网络深度、改变卷积核大小或调节学习率等参数设置来适应不同的需求。通常,PyTorch社区提供详细的文档和支持代码帮助用户快速理解和使用该模型。
  • PyTorch前馈验(使用Torch
    优质
    本实验利用PyTorch框架搭建并训练了一个简单的前馈神经网络,并对其性能进行了评估。通过实践加深了对深度学习模型的理解与应用。 参考文献提供了一个关于如何使用PyTorch实现前馈神经网络的实验教程。这个教程详细介绍了构建一个简单的前馈神经网络的过程,并提供了相应的代码示例以便读者理解和实践。 在该教程中,首先会介绍基本概念以及为什么选择PyTorch作为深度学习框架的原因。接着逐步讲解了如何定义模型架构、如何编写训练循环和损失函数的计算方法等关键步骤。此外还包含了一些实用技巧和建议来帮助优化网络性能并提高实验效率。 通过跟随这个指南进行操作,读者可以更好地掌握使用Python库PyTorch构建和训练前馈神经网络的基础知识与技能。
  • NeRF-PyTorchPyTorch辐射场再
    优质
    简介:NeRF-PyTorch是基于PyTorch框架对神经辐射场(NeRF)模型的重新实现项目。该项目致力于提供一个简洁、高效的代码库,便于研究者和开发者进行三维场景表示与渲染的研究及应用开发。 nerf-pytorch 是 PyTorch 的重新实现版本。该项目由加州大学伯克利分校、Google 研究中心以及加州大学圣地亚哥分校的研究人员合作完成。 速度是这个项目的重点,目前的执行效率非常高!相较于其他实现方式,我们的项目在性能上提升了约5-9倍和2-4倍的速度(具体取决于基准比较)。我们通过多种手段来提升速度:除了常见的数据缓存、有效的内存管理等优化外,还深入研究了整个NeRF代码库,并减少了不必要的黑白数据传输,尽可能地进行矢量化处理以及使用高效的PyTorch操作变体。 项目中包括了一些合成和真实数据的样本结果。我们提供了一个名为 Tiny-NeRF 的 NeRF 代码版本,附带一个 Colab 笔记本以展示如何运行。 所有这些改动都是基于对原始 NeRF 技术的高度尊重:除了上述优化外,其余部分都忠实于原技术框架与理念。