
开放性儿科脑肿瘤图集项目分析库:OpenPBTA-analysis
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简介:
简介:OpenPBTA-analysis是针对儿童脑肿瘤的数据分析平台,提供全面的基因组信息和临床数据,助力科研人员深入研究并开发新的治疗策略。
OpenPBTA项目致力于分析小儿脑肿瘤,这是一种常见的实体瘤,并且是儿童癌症相关死亡的主要原因。由于这些疾病具有独特的分子亚型并且总体上较为罕见,再加上分类错误导致的分组污染问题以及样本量不足等问题的存在,使得我们难以深入理解和有效治疗这类病症。
2018年9月发布了一个基因组数据集(包括全基因组测序、全外显子组测序、RNA测序、蛋白质组学和临床数据),这些资料来自OpenPBTA项目。该项目是一个全球性的开放科学计划,旨在通过实时协作方式全面定义CBTN的943位患者的肿瘤分子特征,并分析PNOC003 DIPG临床试验。
OpenPBTA采用请求模型运作以接受社区参与者的贡献。维护人员已设置持续集成软件来确认项目Docker容器内分析结果的可重复性。该项目使用协作工具编写手稿,以便提供最新的公共版本的手稿内容。项目的维护者包括来自不同机构的研究科学家们。
我们邀请研究人员加入OpenPBTA项目,共同推进小儿脑肿瘤研究的进步和发展。
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