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Pytorch-Segmentation-Multi-Models_NestedUNet_图像分割与血管分割

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简介:
本项目基于PyTorch开发,实现多种图像分割模型,重点展示了Nested UNet架构在处理复杂医学影像(如血管)任务中的优越性能。 Pytorch实现了基于多模型的眼底血管语义分割。所使用的模型包括:Deeplabv3、Deeplabv3+、PSPNet、UNet、UNet autoencoder、UNet nested、R2AttUNet、Attention UNet、Recurrent UNet、SEGNet、CENet、dsenseasp、RefineNet和RDFNet。

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  • Pytorch-Segmentation-Multi-Models_NestedUNet_
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    本项目基于PyTorch开发,实现多种图像分割模型,重点展示了Nested UNet架构在处理复杂医学影像(如血管)任务中的优越性能。 Pytorch实现了基于多模型的眼底血管语义分割。所使用的模型包括:Deeplabv3、Deeplabv3+、PSPNet、UNet、UNet autoencoder、UNet nested、R2AttUNet、Attention UNet、Recurrent UNet、SEGNet、CENet、dsenseasp、RefineNet和RDFNet。
  • 眼底.rar_眼底_
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    本项目为一个关于眼底图像中血管自动识别与分割的研究资料集,包括各类算法、实验数据及结果分析。适用于医学影像处理和眼科疾病辅助诊断研究。 视网膜眼底血管分割程序已用Matlab实现,并且效果良好,大家可以参考学习。
  • .rar
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    本资源包含多种血管图像的数据集,旨在帮助研究者和开发者进行医学影像处理技术的研究与开发。其中包括各类清晰标注的训练样本及测试样本。 通过提取手背血管静脉图样,并利用MATLAB中的图像分析功能将原图进行重合处理。
  • Segmentation-Pytorch:基于Pytorch的语义网络
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    Segmentation-Pytorch 是一个使用 PyTorch 开发的开源库,旨在提供多种先进的语义分割模型和工具,支持快速实验与研究。 项目更新日志 2020.12.10:进行了项目的结构调整,并已删除之前的代码。 2021.04.09:“V1 commit”,重新上传了调整后的代码。 2021.04.22:正在进行torch分布式训练的持续更新。 效果展示(cityscapes): 使用模型 DDRNet 15 在测试集上,官方Miou=78.4069% 平均结果与各类别具体结果如下: - Class results 1 - Class results 2 - Class results 3 原图和预测图对比示例: origingt(原始图像) predict(模型预测) 环境安装:请通过以下命令安装依赖包: ``` pip install -r requirements.txt ``` 实验环境配置如下: 操作系统: Ubuntu 16.04 显卡要求: Nvidia-Cards >= 1 Python版本: python==3.6.5 更多具体依赖的安装信息详见requirement.txt文件。
  • 中基于Hessian矩阵的增强方法.rar_Hessian增强__处理
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    本研究针对心血管分割问题,提出了一种基于Hessian矩阵的血管增强算法,有效提升了血管图像的清晰度和准确性,为后续血管分割提供了有力支持。 利用Hessian矩阵对输入的心血管图像进行增强和分割。
  • 基于区域生长法的MATLAB代码-Image-Segmentation:
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    本项目提供了一套使用MATLAB实现的基于区域生长算法的图像分割代码,旨在帮助用户理解和应用这一技术进行图像处理和分析。 基于区域生长法的图像分割MATLAB代码是Shih和Cheng撰写的论文《用于彩色图像分割的自动播种区域生长》中的方法实现。该方法包含四个主要部分:将RGB图像转换为YCbCr颜色空间、自动选种、基于初始种子进行区域生长以及合并相似区域(这可能包括进一步使用不同阈值来合并具有相近特征的区域)。我所使用的实验图片是从2019年Kaggle图像分割竞赛数据集中随机选取。一些结果如下所示,每个图下面给出最终采用的相似度和大小阈值:初始情况下每张图片采用了相似度为0.1以及总图片面积的1/150的比例作为合并参数。 当使用特定图像来验证方法有效性时,错误的一个迹象是不正确地将不同的颜色区域进行合并。以下是几个测试案例的结果: - 相似度阈值:0.2;尺寸比例:1/80 - 相似度阈值:0.15;尺寸比例:1/100 - 相似度阈值:0.14;尺寸比例:1/60 - 其它案例中,相似度和大小的参数分别为 0.1、 1 / 80 或者更小。 这些结果是在使用了初始设定(即相似度为0.1及总图片面积的1/150)后获得,并且没有进行进一步合并操作。
  • 视网膜眼底三维重建
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    本研究致力于开发先进的算法和技术,用于精确分割视网膜血管图像,并构建眼底血管的三维模型,以提高眼科疾病的诊断和治疗水平。 眼底视网膜图像中的血管分布情况为高血压、糖尿病等疾病的早期诊断提供了重要的参考依据。通过计算机处理这些眼底图像可以减轻医生的重复劳动负担。本段落提出了一种新的用于分割眼底视网膜血管图像的算法,该算法首先利用局部归一化方法来消除背景差异性的影响;然后使用期望最大化算法进行聚类操作以实现精确地分割出血管区域;最后基于眼底成像原理通过投影逆变换构建了三维模型,使得可以从多个角度观察和分析视网膜结构。所建立的这种模型有助于更全面深入地理解与研究相关疾病的情况。
  • 基于MATLAB的ISODATA算法在视网膜中的应用-REITNA-SEGMENTATION
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    本文探讨了利用MATLAB平台实施ISODATA聚类算法于视网膜图像血管分割的应用,旨在提高REITNA-SEGMENTATION系统的精度与效率。 ISODATA算法的Matlab代码用于视网膜图像分割以提取血管复杂结构。详情如下: 用法:运行mainDemo.m 步骤1:从文件夹“retina_images\1.tif”读取matlab工作区中的视网膜图像。 步骤2:将ISODATA算法应用于输入的视网膜图像,用于从中分离出血管部分。使用迭代方法计算全局阈值以实现这一目的。具体来说,函数LEVEL=ISODATA(I)可以用来找到一个归一化的强度值(位于[0,1]范围内),该值可用于通过IM2BW将强度图像转换为二进制图像的全局阈值。这种方法是由Ridler和Calvard开发的一种迭代技术。 步骤3:加载真实视网膜图像(label_images/1.tif)以评估算法性能,即比较分割结果与实际目标区域之间的匹配程度。此时我们有两个对比对象,一个代表真实的视网膜结构图(groundtruth),另一个则是通过ISODATA算法得到的分割结果图。为了量化这种算法的效果,计算了“真阳性”、“假阳性”,以及“真阴性”和“假阴性”的比率来进行评估。 以上是整个流程的大致描述,具体细节可以参考对应的代码文件来进一步了解实现方式。