
CRIMAC预处理:将.raw格式的声学数据转换为网格格式
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简介:
CRIMAC预处理工具用于将原始声学数据(.raw格式)高效地转化为易于分析和可视化的网格格式,助力海洋生物研究。
该存储库包含用于预处理CRIMAC项目声学数据的代码,并使用软件包的Docker镜像来将SIMRAD EK60/EK80声学原始文件集合转换为xarray数据集,然后将其保存为磁盘上的zarr/netcdf文件。此外,现在还支持将Marec LSSS工作文件预处理成pandas数据帧(请参见下面的磁盘安装选项)。特征包括自动范围重新网格化,默认情况下使用第一个原始文件中主通道的范围,请参阅MAX_RANGE_SRC选项。SV处理和Dask通道是并行完成的,利用了Dask延迟机制。如果输出文件存在,则会从上次ping_time处自动恢复。批处理通过直接附加到输出文件来实现,这应该提高了内存效率。
该存储库的镜像可以在Docker Hub上获取。.work文件中的注释会被处理成pandas数据.work对象(使用::)。
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