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MATLAB中恢复先前代码以进行DeNeRD操作:一种针对深度学习的全脑神经元高通量检测方法

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简介:
本研究提出了一种基于MATLAB的高效算法,用于恢复先前代码并执行DeNeRD操作,旨在实现对整个大脑内神经元的高通量、精准定位和分析,特别适用于深度学习框架。 为了恢复之前在MATLAB环境中运行的DeNeRD代码以进行高通量神经元检测及全脑分析,请按照以下步骤操作:该程序已经在配备NVIDIA Quadro P4000 GPU的Windows 10系统上成功测试过。 首先,您需要克隆DeNeRD存储库。然后,在数据集上运行DeNeRD的具体步骤如下: 1. 将您的数据集图像复制或下载,并放置于“/dataset”文件夹中。您可以将每个大脑区域(如.png/.jpg格式)的图片放在子目录下,例如:i01, i02,..., iN。作为示例,来自Allen Brain的数据中的四个部分已经被放入相应的文件夹里。 2. 在数据集的各个子目录内浏览,并运行以下脚本: imsection_DeNeRD(image_num,image_num,pad_size,pad_color,resize_ratio) 其中image_n表示您想要处理的具体图像编号。

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  • MATLABDeNeRD
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    本研究提出了一种基于MATLAB的高效算法,用于恢复先前代码并执行DeNeRD操作,旨在实现对整个大脑内神经元的高通量、精准定位和分析,特别适用于深度学习框架。 为了恢复之前在MATLAB环境中运行的DeNeRD代码以进行高通量神经元检测及全脑分析,请按照以下步骤操作:该程序已经在配备NVIDIA Quadro P4000 GPU的Windows 10系统上成功测试过。 首先,您需要克隆DeNeRD存储库。然后,在数据集上运行DeNeRD的具体步骤如下: 1. 将您的数据集图像复制或下载,并放置于“/dataset”文件夹中。您可以将每个大脑区域(如.png/.jpg格式)的图片放在子目录下,例如:i01, i02,..., iN。作为示例,来自Allen Brain的数据中的四个部分已经被放入相应的文件夹里。 2. 在数据集的各个子目录内浏览,并运行以下脚本: imsection_DeNeRD(image_num,image_num,pad_size,pad_color,resize_ratio) 其中image_n表示您想要处理的具体图像编号。
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