陈连福的生物信息分析Perl程序，名为blast.pl。

简介：
Usage: /home/chenlianfu/chenlianfu_scripts/blast.pl [options] 执行BLAST程序。该脚本用于设置临时文件或文件夹的前缀，默认情况下，程序会生成command.blast.list、blast.tmp/等临时文件或目录。--chunk default: 10 指定每个数据块包含的序列条数。程序会将输入FASTA文件中的序列按顺序分割成若干份，每份包含10条相邻的序列，并分别存储在独立的FASTA文件中。这些FASTA文件将被放置在blast.tmp/临时文件夹下的子目录中，每个子目录存放10个FASTA文件，同时每个FASTA文件将对应一条BLAST命令写入到command.blast.list文件中；随后，ParaFly程序将被调用以进行并行计算。请务必注意：当数据块的数量超过100万个时，默认设置下blast.tmp/文件夹中的子目录数量会显著增加（超过1万个），从而导致文件系统运行速度变慢以及ParaFly程序的运行效率降低，最终无法充分利用服务器的计算资源。因此，建议设置--chunk参数值为100。 --blast-program default: blastp 定义用于执行的BLAST命令，可选项包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, 和 tblastx。--CPU default: 1 配置并行运行的BLAST程序数量。--blast-threads default: 1 设置BLAST命令中的-num_threads参数值，允许每个BLAST命令使用多线程并行处理。请留意：--blast-threads参数值与--CPU参数值的乘积不应超过服务器总计算线程数。 --evalue default: 1e-3 设定BLAST命令中的-evalue参数值，用于控制搜索结果的相关性阈值。--outfmt default: 5 指定BLAST命令中的-outfmt参数值，定义输出格式。当设置为5时，输出结果将采用XML格式；若设置为6或7，则输出表格形式的结果。--max-target-seqs default: 20 配置BLAST命令中的-max_target_seqs参数值，限制BLAST最多匹配数据库中序列的数量。 -clean 若添加此选项，则程序在成功执行完毕后会自动删除所有临时文件或文件夹。