
UmUTracker: 适用于2D粒子追踪及基于3D DHM追踪的MATLAB工具 - 开源版本
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简介:
UmUTracker是一款开源的MATLAB工具,专为2D粒子追踪和基于3D数字全息显微镜(DHM)的复杂追踪设计,旨在简化科研人员的数据分析流程。
我们提供了一种通用且快速的MATLAB程序(UmUTracker),该程序可以通过分析由光学显微镜或数字全息显微镜采集的长视频序列来自动检测和跟踪粒子。我们的程序使用等腰三角形变换找到二维粒子中心位置,并通过一维径向强度轮廓,利用快速实施的Rayleigh-Sommerfeld数值重建算法确定轴向位置。
更新v1.1于2017年11月21日发布,修复了错误并增加了Blob检测功能。
请参阅我们的主页以获取更多信息。引用我们的工作时,请使用以下信息:Zhang, H., T. Stangner, K. Wiklund, A. Rodriguez and M. Andersson (2017). UmUTracker: a generic MATLAB program for automated particle tracking in 2D optical microscopy or 3D digital holographic data. Computer Physics Communications 219: 390-399。
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