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LWNet:领先的视网膜血管分割及简约模型

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简介:
LWNet是一种先进的深度学习模型,专为视网膜血管精确分割而设计。它不仅提高了医学图像分析的效率和准确性,还通过优化架构实现了轻量化,便于在资源受限环境下应用。 您可以访问我们使用简约模型进行视网膜血管分割工作的官方存储库。上图展示了一个 WNet 架构,它包含大约 7 万个参数,并且在性能上接近或优于其他更复杂的技术。有关更多详细信息,请查阅相关论文:《The Little W-Net That Could: State-of-the-Art Retinal Vessel Segmentation with Minimalistic Models》(Adrian Galdran, André Anjos, Jose Dolz, Hadi Chakor, Hervé Lombaert, Ismail Ben Ayed)。如果您使用我们的工作并发现它对您有所帮助,我们非常感谢您的引用。

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  • LWNet
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    LWNet是一种先进的深度学习模型,专为视网膜血管精确分割而设计。它不仅提高了医学图像分析的效率和准确性,还通过优化架构实现了轻量化,便于在资源受限环境下应用。 您可以访问我们使用简约模型进行视网膜血管分割工作的官方存储库。上图展示了一个 WNet 架构,它包含大约 7 万个参数,并且在性能上接近或优于其他更复杂的技术。有关更多详细信息,请查阅相关论文:《The Little W-Net That Could: State-of-the-Art Retinal Vessel Segmentation with Minimalistic Models》(Adrian Galdran, André Anjos, Jose Dolz, Hadi Chakor, Hervé Lombaert, Ismail Ben Ayed)。如果您使用我们的工作并发现它对您有所帮助,我们非常感谢您的引用。
  • 基于UNet代码
    优质
    本项目提供了一种基于UNet架构的深度学习模型,用于自动分割视网膜图像中的血管结构。该代码旨在辅助医学研究与临床诊断,提高视网膜疾病的检测效率和准确性。 UNet医学影像分割源码的文件结构如下: - src:包含搭建U-Net模型的相关代码。 - train_utils:包括训练、验证以及多GPU训练所需的模块。 - my_dataset.py:自定义数据集类,用于读取DRIVE数据集(视网膜血管分割)。 - train.py:以单个GPU为例的训练脚本示例。 - train_multi_GPU.py:专为使用多个GPU进行训练而设计的脚本。 - predict.py:简易预测脚本,利用已训练好的权重文件对新图像进行预测测试。 - compute_mean_std.py:统计数据集各通道均值和标准差。
  • Retina-VesselNet:基于TensorFlow2化U-net用于-源码
    优质
    本项目提供一个基于TensorFlow2的精简版U-net模型——Retina-VesselNet,专为视网膜血管图像分割设计。代码开源以促进相关研究与应用开发。 由于该项目已于2021年3月18日升级到Tensorflow 2.3版本,因此可以找到停止维护的旧分支: - [2019-6-9] keras-tensorflow 分支: - [2018-5-2] keras-theano 分支: 项目结构包括一个简单的U-net模型用于视网膜血管分割,并带有DRIVE数据集。我们提供了两个版本的项目,它们在实现上完全一致。 建议首先运行其中一个版本以获得直观演示。不同笔记本有不同的用途: - EntireBookForColab.ipynb 包含项目的完整部分,如过程、训练和测试。 - PreprocessIllustration.ipynb 展示了一些视网膜图像的预处理方法。 - TestAndEvaluation.ipynb 用于评估。 选择一个版本并开始使用吧!
  • 基于深度类与图像提取
    优质
    本研究提出了一种创新的深度学习模型,专门用于从视网膜图像中高效、准确地提取血管结构。该模型结合了先进的分类和分割技术,显著提升了血管检测精度,为眼疾早期诊断提供了有力工具。 视网膜图像中血管提取的深度分类和分割模型
  • 图像与眼底三维重建
    优质
    本研究致力于开发先进的算法和技术,用于精确分割视网膜血管图像,并构建眼底血管的三维模型,以提高眼科疾病的诊断和治疗水平。 眼底视网膜图像中的血管分布情况为高血压、糖尿病等疾病的早期诊断提供了重要的参考依据。通过计算机处理这些眼底图像可以减轻医生的重复劳动负担。本段落提出了一种新的用于分割眼底视网膜血管图像的算法,该算法首先利用局部归一化方法来消除背景差异性的影响;然后使用期望最大化算法进行聚类操作以实现精确地分割出血管区域;最后基于眼底成像原理通过投影逆变换构建了三维模型,使得可以从多个角度观察和分析视网膜结构。所建立的这种模型有助于更全面深入地理解与研究相关疾病的情况。
  • 图像算法,以Python实现
    优质
    本研究聚焦于视网膜血管图像的精确分割技术,并采用Python编程语言实现相关算法,旨在提高血管识别准确性与效率,为眼科疾病早期诊断提供技术支持。 基于CNN的视网膜血管图像分割模型采用U-net架构搭建而成,并使用Keras作为框架、TensorFlow作为后端。整个项目通过Python进行接口开发。
  • 基于U-Net(Pytorch实现)
    优质
    本项目采用Pytorch框架实现了基于U-Net的深度学习模型,专为视网膜血管自动分割设计,旨在提高眼底疾病诊断的准确性和效率。 代码适配数据集需要根据数据集的特点进行相应的调整和优化,确保程序能够高效准确地处理数据。这通常包括对算法的选择、参数的调优以及可能的数据预处理步骤等。在开始编码之前,深入理解数据集的需求和限制是至关重要的。
  • 自动病变图像中
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    本研究提出了一种创新算法,专门用于自动识别并分割病变视网膜图像中的复杂血管网络。通过优化现有技术,我们的方法能够更精确地捕捉细微血管结构,为早期诊断和治疗眼科疾病提供关键支持,尤其在糖尿病性视网膜病变等病症的评估中展现巨大潜力。 现有的视网膜血管分割方法大多只适用于正常视网膜图像的处理,并不能有效应对病变情况下的图像分割问题。为此,提出了一种新的针对病变视网膜图像进行血管网络分割的方法。 该方法首先利用向量场散度技术来确定大部分血管在病变视网膜中的中心线位置;接下来计算出这些中心线上每个像素的方向信息,并通过改进的定向局部对比度算法识别出位于中心线两侧的血管区域。最后,采用反向外推追踪策略处理获得的血管段末端部分,从而完整地分割出整个血管网络。 实验结果表明,在使用通用STARE眼底图像库中的所有病变视网膜图像进行测试时,该方法取得了0.9426的ROC曲线面积和0.9502的准确率。相比Hoover算法及Benson等人提出的方案,本段落提出的方法在性能上有了明显的提升,并且克服了后者对不同种类病变图像处理上的局限性问题,展现出良好的鲁棒性。
  • VesselSeg-Pytorch:用于Pytorch工具包
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    简介:VesselSeg-Pytorch是一款基于Pytorch开发的视网膜血管分割工具包,旨在提供高效、准确的视网膜血管自动识别解决方案。 VesselSeg-Pytorch:基于pytorch的视网膜血管分割工具包 介绍: 该项目是使用Python和PyTorch框架开发的视网膜血管分割代码库,包含数据预处理、模型训练与测试及可视化等功能模块。适用于从事视网膜血管分割研究的研究人员。 要求: 项目的python环境所需的主要软件包及其版本如下所示: - python:3.7.9 - pytorch:1.7.0 - torchvision:0.8.0 - cudatoolkit:10.2.89 - cudnn:7.6.5
  • 基于自适应尺度信息U算法
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    本研究提出了一种基于自适应尺度信息的U型网络模型,用于精确提取视网膜图像中的血管结构,提升眼科疾病早期诊断效率。 为了应对视网膜血管形态结构及其尺度信息的复杂性和多变性问题,我们提出了一种自适应处理这些特性的U型视网膜血管分割算法。首先运用二维K-L(Karhunen-Loeve)变换对彩色图像三通道中的频带信息进行综合分析,从而生成视网膜灰度图像,并通过多尺度形态学滤波增强血管与背景的对比度。 随后,将预处理后的图像输入到U型分割模型中进行端对端训练。在此过程中,利用局部信息熵采样技术来进行数据增强。编码部分采用密集可变形卷积结构以根据上下特征层的信息有效捕捉多种尺度和形状的信息;底部则采用了金字塔形的多尺度空洞卷积来扩大局部感受野范围,同时解码阶段引入了带有注意力机制(Attention)的反卷积网络,以此将底层与高层特征映射有效地结合在一起。通过这些改进措施解决了权重分散以及图像纹理损失的问题。 最终结果由SoftMax激活函数得出并作为分割输出呈现。在DRIVE和STARE数据集上的仿真测试中显示出了优异的表现:准确率分别达到了97.48%和96.83%,特异性分别为98.83%与97.75%;总体性能超越了现有的多种算法。