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VASP_XDATCAR:解析VASP XDATCAR文件的Python类(来自分子动力学)

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简介:
本Python类用于解析VASP计算中产生的XDATCAR文件,专门处理并提取分子动力学模拟中的原子坐标数据。 VASP_XDATCAR 是一个用于解析 VASP XDATCAR 文件的 Python 类,该文件包含分子动力学模拟过程中每个时间步上所有原子的位置数据。 通过这些位置信息,我们可以计算出以下物理量: - 系统随时间变化的温度。 - 速度自相关函数(VAF)和声子密度。 - 对相关函数(PCF)。 注意事项: - 在 INCAR 文件中设置 NBLOCK = 1,以确保分子动力学运行过程中所有配置都写入 XDATCAR 文件。 - 元素质量和 MD 时间步长从 OUTCAR 文件读取。

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  • VASP_XDATCARVASP XDATCARPython
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    本Python类用于解析VASP计算中产生的XDATCAR文件,专门处理并提取分子动力学模拟中的原子坐标数据。 VASP_XDATCAR 是一个用于解析 VASP XDATCAR 文件的 Python 类,该文件包含分子动力学模拟过程中每个时间步上所有原子的位置数据。 通过这些位置信息,我们可以计算出以下物理量: - 系统随时间变化的温度。 - 速度自相关函数(VAF)和声子密度。 - 对相关函数(PCF)。 注意事项: - 在 INCAR 文件中设置 NBLOCK = 1,以确保分子动力学运行过程中所有配置都写入 XDATCAR 文件。 - 元素质量和 MD 时间步长从 OUTCAR 文件读取。
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