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UNET论文PDF

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简介:
本文档为《UNET: 一种用于生物医学图像分割的深度学习方法》的研究论文,详细阐述了基于U型网络结构的模型在处理小样本、高复杂度医学影像数据中的应用与优势。 UNet论文用于医学图像分割,并且可以应用于细胞分割。

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    本文档为《UNET: 一种用于生物医学图像分割的深度学习方法》的研究论文,详细阐述了基于U型网络结构的模型在处理小样本、高复杂度医学影像数据中的应用与优势。 UNet论文用于医学图像分割,并且可以应用于细胞分割。
  • Unet:U-Net.pdf
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    《U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation》是一篇提出用于生物医学图像分割的U形卷积神经网络架构的重要论文。该模型通过巧妙地结合特征映射的下采样与上采样,成功实现了精准高效的医疗影像分析,在医学领域具有深远影响。 U-Net是一种为生物医学图像分割设计的卷积神经网络,在2015年由Olaf Ronneberger、Philipp Fischer 和Thomas Brox提出。这项工作展示了如何仅使用少量标注样本进行高效训练,这在当时的深度学习领域是一项重要的突破。该论文发表于ISBI挑战赛中,并且U-Net在网络性能上表现优异,尤其在电子显微镜图像的神经结构分割以及传输光显微镜图像中的细胞跟踪任务中取得了显著成绩。 论文的核心思想在于通过数据增强来高效利用标注数据,其网络架构包括两个主要部分:收缩路径(contracting path)和扩展路径(expanding path)。收缩路径用于捕获上下文信息,而扩展路径则使用上采样技术实现高分辨率的图像分割,从而达到精确的定位效果。整个网络能够从非常少的图像样本中进行端到端训练,并且在性能上超越了之前的方法,如滑动窗口卷积网络(sliding-window convolutional network)。 U-Net特别适合于生物医学图像处理领域,在许多视觉任务中需要对不同区域的具体内容进行识别而不仅仅是简单的分类标签。这通常比图像分类问题复杂得多。U-Net的结构被设计成对称,这种设计模仿了人类视觉感知的方式,并且能够在不同分辨率下保持图像信息。 在实现过程中,作者使用Caffe框架并发布了完整的网络实现和训练好的模型,使得研究者和开发者可以轻松获取并在自己的项目中应用此技术。这大大降低了深度学习在生物医学图像处理领域中的门槛。 论文的贡献不仅在于提出了一种新的网络架构,更重要的是展示了一种能够有效应对生物医学图像数据稀缺问题的训练方法。由于获得大量高质量标注的数据非常昂贵和耗时,在这一领域的研究者需要一种可行解决方案,而U-Net正好满足了这种需求。 此外,U-Net具有很高的计算效率,并且能够在现代GPU上以不到一秒的时间分割一个512x512大小的图像。这对于实际应用来说意味着可以实现实时或近实时处理大量图像的需求,在临床应用场景中尤其有价值。 总的来说,U-Net及其后续变体为生物医学图像分割领域带来了突破性的进展,并且随着深度学习技术的发展,这些方法在各种图像处理任务中的应用将会更加广泛,特别是在临床医学、生物学研究以及相关领域。
  • +代码】Swin-Unet:类似Unet的纯Transformer医学图像分割模型
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    本文提出了一种基于纯Transformer架构的新型医学图像分割模型——Swin-Unet。该模型借鉴了U-Net的设计理念,利用Swin Transformer作为其核心组件,展现了在医学影像领域中的卓越性能和潜力。同时提供了完整的代码实现以供参考和研究使用。 【论文+代码】Swin-Unet:一种类似Unet的纯Transformer模型用于医学图像分割。代码已亲测可运行,想要对代码进行改进可以从main.py文件开始。
  • unet-sense.zip
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    Unet-Sense 是一个基于 UNET 模型的应用程序或工具包,旨在提供特定领域的智能感知和分析功能。此文件包含其源代码及相关资源。 使用PyTorch实现的UNet++可以用于分割遥感图像。该方法通过改进原始的UNet架构,在多尺度特征融合方面取得了较好的效果,适用于复杂的遥感图像数据处理任务。此代码实现了深度学习模型在遥感领域的应用,并展示了如何利用增强的网络结构提高目标检测和区域划分的准确性。
  • 利用PyTorch实现UNet网络(如所述)
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    本项目基于PyTorch框架实现了经典的UNet网络模型,严格遵循相关学术论文中的描述与技术细节,适用于医学图像分割任务。 设计神经网络的一般步骤包括:1. 设计框架;2. 设计骨干网络。 对于Unet网络的设计步骤如下: 1. 创建Unet工厂模式; 2. 定义编解码结构; 3. 实现卷积模块; 4. 构建unet实例模块。 Unet网络的关键特征有: 1. 具备编码和解码的双层架构,其中解码部分比FCN更为精细和完善。 2. 使用了跳跃连接的方式进行信息传递。 3. 本质上是一个框架结构,在编码阶段可以采用多种图像分类网络作为基础模型。 示例代码如下: ```python import torch import torch.nn as nn class Unet(nn.Module): # 初始化参数:Encoder, Decoder,以及桥接部分(bridge,默认为None) def __init__(self, Encoder=None, Decoder=None, bridge=None): super(Unet,self).__init__() if bridge is not None: self.bridge = bridge ```
  • 基于PyTorch的UNet网络实现(如所述)
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    本项目基于PyTorch框架实现了类似于论文中描述的UNet网络架构,用于医学图像分割任务。代码结构清晰,便于研究和应用。 本段落主要介绍了如何使用PyTorch实现论文中的UNet网络,并具有很好的参考价值,希望能对大家有所帮助。一起跟随小编来看看吧。
  • UNET-ZOO: 包含UNetUNet++、Attribute-UNet、R2UNet、CENet和SegNet、FCN
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    UNET-ZOO是一个综合性的深度学习模型集合,内含多种先进的编码器解码器架构如UNet系列(包括UNet、UNet++)、Attribute-UNet、R2UNet以及其它用于图像分割的经典网络CENet和SegNet。 UNET-ZOO 包含 unet、unet++、attribute-unet、r2unet、cenet、segnet 和 fcn。运行环境为 Windows 10 或 Ubuntu 系统,使用 PyCharm 编程工具以及 Python3.6 版本和 Pytorch1.3.1。 要开始操作,请先修改 dataset.py 文件中的数据集路径。然后按照以下命令示例进行操作:python main.py --action train&test --arch UNet --epoch 21 --batch_size 21 执行上述指令后,将会生成三个文件夹:“结果”、“saved_model”和“saved_predict”。 - saved_model 文件夹中会保存经过训练后的模型。 - 结果文件夹内包含指标的日志以及折线图等信息。 - 在 saved_predict 文件夹里则存放预测相关的结果。
  • PyTorch-Unet
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    PyTorch-Unet是一款基于PyTorch框架实现的深度学习模型,主要用于医学图像分割任务中。该网络结构由编码器和解码器组成,能够有效捕捉输入数据的空间特征信息。 使用PyTorch进行语义分割的UNet模型在Kaggle高清图像挑战赛上进行了自定义实施。该模型从头开始训练,共用了5000张图像(没有数据增强),并在超过10万张测试图像上获得了得分0.988423(总分735中得分为511)。可以通过增加更多的培训、使用数据增强技术、微调以及在预测阶段应用CRF后处理来进一步提高模型性能,此外,在蒙版边缘施加更多权重也有助于改进结果。训练好的模型可以保存为MODEL.pth文件,并通过命令行接口轻松地对单个或多个图像进行测试以生成输出蒙版。 要使用该模型,请按照以下步骤操作: - 对单一图像预测并保存其掩码:执行 `python predict.py -i image.jpg -o output.jpg` - 预测多幅图像并在屏幕上显示结果而不保存它们:执行 `python predict.py -i image1.jpg image2.jpg --viz`
  • SA-UNet: 开源的SA-UNet代码
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    简介:SA-UNet是一款开源的深度学习模型代码,基于U型网络架构并引入了自适应模块,专为医学图像分割任务优化设计。 该代码适用于论文《用于视网膜血管分割的空间注意U-Net》。我们在DRIVE和CHASE DB1数据集上报告了最新的性能结果。此代码由布达佩斯技术经济大学(CME)的郭长禄编写。 我们的训练与评估在Ubuntu 16.04系统下进行,但同样适用于Windows和其他操作系统环境。对于数据扩充部分包括:(1) 随机旋转; (2) 增加高斯噪声; (3) 色彩抖动;以及(4)水平、垂直和对角线翻转。 如果您不需要上述的数据增强操作,可以直接获取代码进行使用。训练时可以运行相关脚本,测试或评估则可以通过相应的命令执行。 环境需求:Keras 2.3.1 和 Tensorflow = 1.14.0 关于Keras:这是一个简洁且模块化程度高的神经网络库,用Python编写,并可在TensorFlow或者Theano上运行。它的设计重点在于快速实验与实现想法的便捷性。