
基于区域生长法的图像分割MATLAB代码及NeuriteTracker:一款用于高通量检测与追踪活细胞成像中迁移神经元及其突起的软件
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简介:
本项目提供了一套基于区域生长算法实现图像分割的MATLAB代码,并介绍了NeuriteTracker,一个专为分析活体细胞内神经元及其突起动态变化而设计的高通量工具。
Neuritetracker是一款用于活细胞成像中的神经元或类似细胞的高通量检测、跟踪及分割的软件工具。它能够分析图像序列,并将结果以电影文件和CSV格式存储起来。用户既可以使用图形界面操作单个数据集,也可以通过编写Matlab脚本来进行批量处理。
安装Neuritetracker的方法如下:
1. 首先确保你的计算机上已安装了C/C++编译器的许可版本。
2. 使用命令行工具克隆neuritetracker存储库:`git clone git@github.com:sgbasel/neuritetracker.git neuritetracker`
3. 或者,你可以直接下载该存储库。如果选择了ZIP文件形式,则需要解压存档。
在单个序列上运行Neuritetracker的步骤如下:
1. 打开Matlab。
2. 在neuritetracker/trunk目录下执行`neuritetracker_gui`函数以启动GUI界面。
3. 选择包含你待处理图像的数据集。
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