
DMC实验室进行酵母分类。
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简介:
酵母分类的开发依赖于Python环境,具体而言是在Python 3.7.9版本上进行了测试。运行相应的脚本和图形用户界面(GUI)预计能够成功启动。为了确保开发环境的稳定性和可控性,建议采用Anaconda平台,经过验证该平台可以提供一个正常工作的环境。然而,所包含的YAML构建环境可能包含一些冗余的库,但仍然可以通过后续更新来优化该文件。具体而言,可以使用conda env create -f TEST_ENVIRONMENT.yml命令来创建环境,并利用PyPi作为包源(尽管包源可能会发生变更)。此外,需要安装以下必要的库:OpenCV(通过pip install opencv-python 和 pip install numpy 安装),Matplotlib(通过pip install matplotlib安装),Scikit-learn(通过pip install -U scikit-learn安装),PlantCV(通过pip install plantcv安装),Shutil(通过pip install pytest-shutil 安装)。
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