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MATLAB成绩分析代码-PHESANT-MR-pheWAS-BMI: Phesant-MR-pheWAS-BMI

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简介：
本项目使用MATLAB编写，旨在通过Phesant-MR-pheWAS框架进行BMI相关表型的两样本孟德尔随机化分析和成绩评估。代码集成了数据处理、统计分析等功能模块。 在MATLAB中分析成绩代码并使用PHESANT进行BMI的MR-pheWAS研究，参考文献如下：Millard, LAC等人通过孟德尔随机化方法（bioRxiv, 2017）在超过30万个体的研究中寻找BMI的因果关系。环境细节包括使用的语言版本为R-3.3.1、ATLAS和Statav14以及Matlab-r2015a，软件包使用v0.15版本。 该代码执行过程中需要设置一些环境变量，这些变量分为两类：永久性设置（适用于多个项目）与临时性设置（仅针对当前项目）。为了设定结果目录及项目数据目录的临时值，我采用了以下命令： ``` export RES_DIR=${HOME}/2016-biobank-mr-phewas-bmi/results/sample500k export PROJECT_DATA=${HOME}/2016-biobank-mr-phewas-bmi/data/sample500 ``` 为了使IEU共享UKB数据目录和PHESANT代码目录的永久性设置生效，将上述命令加入到~/.bash_profile文件中。

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  • MATLAB成绩分析代码-PHESANT-MR-pheWAS-BMI: Phesant-MR-pheWAS-BMI
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    本项目使用MATLAB编写，旨在通过Phesant-MR-pheWAS框架进行BMI相关表型的两样本孟德尔随机化分析和成绩评估。代码集成了数据处理、统计分析等功能模块。 在MATLAB中分析成绩代码并使用PHESANT进行BMI的MR-pheWAS研究，参考文献如下：Millard, LAC等人通过孟德尔随机化方法（bioRxiv, 2017）在超过30万个体的研究中寻找BMI的因果关系。环境细节包括使用的语言版本为R-3.3.1、ATLAS和Statav14以及Matlab-r2015a，软件包使用v0.15版本。 该代码执行过程中需要设置一些环境变量，这些变量分为两类：永久性设置（适用于多个项目）与临时性设置（仅针对当前项目）。为了设定结果目录及项目数据目录的临时值，我采用了以下命令： ``` export RES_DIR=${HOME}/2016-biobank-mr-phewas-bmi/results/sample500k export PROJECT_DATA=${HOME}/2016-biobank-mr-phewas-bmi/data/sample500 ``` 为了使IEU共享UKB数据目录和PHESANT代码目录的永久性设置生效，将上述命令加入到~/.bash_profile文件中。
     
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