
使用MONAI框架和UNet网络对KiTS19数据集的医学CT图像进行分割任务的Python代码及项目文档.zip
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简介:
本资料包包含基于MONAI框架与UNet模型针对KiTS19数据集开展肾脏肿瘤CT影像分割任务的完整Python代码及详细项目说明。
【资源说明】1. 该资源包括项目的全部源码,下载后可以直接使用!2. 本项目适合作为计算机、数学、电子信息等相关专业的课程设计、期末大作业或毕业设计项目,作为参考资料学习借鉴。3. 如果需要实现其他功能,则需能看懂代码,并且热爱钻研,自行调试。
【任务】:利用MONAI框架中的UNet网络完成KiTS19数据集的肾脏和肿瘤分割任务。
在MONAI框架中提供了多种预设模型(如UNet、UNetr等),只需直接引入所需网络即可进行训练。
#### 文件描述
- **目录结构**
- UNet:原始代码及注释文件
- BasicUNet:basicUNet相关实现与资源
**BasicUNet 目录下包含以下内容**
1. `basicunet.py`:网络的训练脚本。
2. `check_best_crop.py`:使用分割效果最佳图像,展示并保存器官分割结果。
3. `check_pro_pict.py`:查看未处理的原始图像及其标签,并进行可视化与存储操作。
4. `find_best_cut.py`:查找最优切割方案以提高模型性能,同时生成相关图表用于评估。
5. `plot.py`:通过读取先前保存的数据重新绘制训练过程中的分割精度及损失函数变化曲线,并将其输出为文件形式。
6. `read_dir.py`:遍历指定路径下的所有数据目录并转换成JSON格式以便后续处理和管理。
7. `result_analysis.py`:针对测试集进行多器官的分割准确度计算与评估。
**其他资源**
- dataset: 源数据存放位置
- pictures: 图像存储区域,用于存放生成的各种图表及可视化结果等
- results: 训练完成后模型参数保存目录
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